Paket: lagan (2.0-6)

[ Källkod: lagan  ]

highly parametrizable pairwise global genome sequence aligner

Lagan takes local alignments generated by CHAOS as anchors, and limits the search area of the Needleman-Wunsch algorithm around these anchors.

Multi-LAGAN is a generalization of the pairwise algorithm to multiple sequence alignment. M-LAGAN performs progressive pairwise alignments, guided by a user-specified phylogenetic tree. Alignments are aligned to other alignments using the sum-of-pairs metric.

Andra paket besläktade med lagan

• dep: libc6 (>= 2.29)

  GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
  också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [ej armel, armhf]

  GCC stödbibliotek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  GNU standardbibliotek v3 för C++

Hämta lagan

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer

Arkitektur	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
amd64	174,9 kbyte	820,0 kbyte	[filförteckning]
arm64	169,4 kbyte	736,0 kbyte	[filförteckning]
armel	159,7 kbyte	665,0 kbyte	[filförteckning]
armhf	160,2 kbyte	565,0 kbyte	[filförteckning]
i386	183,8 kbyte	821,0 kbyte	[filförteckning]
mips64el	179,1 kbyte	832,0 kbyte	[filförteckning]
mipsel	181,0 kbyte	761,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64el	196,7 kbyte	1.888,0 kbyte	[filförteckning]
s390x	170,7 kbyte	784,0 kbyte	[filförteckning]