Пакунок: lagan (2.0-10 and others)

[ Source: lagan  ]

highly parametrizable pairwise global genome sequence aligner

Lagan takes local alignments generated by CHAOS as anchors, and limits the search area of the Needleman-Wunsch algorithm around these anchors.

Multi-LAGAN is a generalization of the pairwise algorithm to multiple sequence alignment. M-LAGAN performs progressive pairwise alignments, guided by a user-specified phylogenetic tree. Alignments are aligned to other alignments using the sum-of-pairs metric.

Інші пакунки пов'язані з lagan

• dep: libc6 (>= 2.34) [not alpha, arm64, ia64, sh4]

  Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.38) [arm64]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
  also a virtual package provided by libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

  Допоміжна бібліотека GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  Допоміжна бібліотека GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  Допоміжна бібліотека GCC

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  Стандартна бібліотека C++ GNU, версії 3

• dep: libunwind8 [ia64]

  library to determine the call-chain of a program - runtime

Завантажити lagan

Завантаження для всіх доступних архітектур

Архітектура	Версія	Розмір пакунка	Розмір після встановлення	Файли
alpha (unofficial port)	2.0-10	178.8 kB	1,898.0 kB	[список файлів]
amd64	2.0-10	179.9 kB	834.0 kB	[список файлів]
arm64	2.0-10+b1	173.2 kB	1,771.0 kB	[список файлів]
armel	2.0-10	163.2 kB	691.0 kB	[список файлів]
armhf	2.0-10	162.4 kB	583.0 kB	[список файлів]
hppa (unofficial port)	2.0-10	174.6 kB	716.0 kB	[список файлів]
i386	2.0-10	186.7 kB	831.0 kB	[список файлів]
ia64 (unofficial port)	2.0-10	213.5 kB	1,035.0 kB	[список файлів]
m68k (unofficial port)	2.0-10	155.6 kB	683.0 kB	[список файлів]
mips64el	2.0-10	182.3 kB	1,924.0 kB	[список файлів]
ppc64 (unofficial port)	2.0-10	190.5 kB	2,034.0 kB	[список файлів]
ppc64el	2.0-10	199.0 kB	1,898.0 kB	[список файлів]
riscv64	2.0-10	180.8 kB	682.0 kB	[список файлів]
s390x	2.0-10	186.6 kB	802.0 kB	[список файлів]
sh4 (unofficial port)	2.0-10	179.3 kB	1,747.0 kB	[список файлів]
sparc64 (unofficial port)	2.0-10	166.3 kB	23,868.0 kB	[список файлів]
x32 (unofficial port)	2.0-10	174.9 kB	796.0 kB	[список файлів]