Paket: lagan (2.0-9)

[ Källkod: lagan  ]

highly parametrizable pairwise global genome sequence aligner

Lagan takes local alignments generated by CHAOS as anchors, and limits the search area of the Needleman-Wunsch algorithm around these anchors.

Multi-LAGAN is a generalization of the pairwise algorithm to multiple sequence alignment. M-LAGAN performs progressive pairwise alignments, guided by a user-specified phylogenetic tree. Alignments are aligned to other alignments using the sum-of-pairs metric.

Andra paket besläktade med lagan

• dep: libc6 (>= 2.29)

  GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
  också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [ej armel, armhf]

  GCC stödbibliotek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 11)

  GNU standardbibliotek v3 för C++

Hämta lagan

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer

Arkitektur	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
amd64	179,3 kbyte	835,0 kbyte	[filförteckning]
arm64	170,3 kbyte	1.771,0 kbyte	[filförteckning]
armel	163,8 kbyte	1.748,0 kbyte	[filförteckning]
armhf	163,2 kbyte	1.748,0 kbyte	[filförteckning]
i386	187,1 kbyte	836,0 kbyte	[filförteckning]
mips64el	182,8 kbyte	1.865,0 kbyte	[filförteckning]
mipsel	185,5 kbyte	1.844,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64el	200,1 kbyte	1.963,0 kbyte	[filförteckning]
s390x	172,6 kbyte	795,0 kbyte	[filförteckning]