Paket: lagan (2.0-10 ve diğerleri)

[ Kaynak: lagan  ]

highly parametrizable pairwise global genome sequence aligner

Lagan takes local alignments generated by CHAOS as anchors, and limits the search area of the Needleman-Wunsch algorithm around these anchors.

Multi-LAGAN is a generalization of the pairwise algorithm to multiple sequence alignment. M-LAGAN performs progressive pairwise alignments, guided by a user-specified phylogenetic tree. Alignments are aligned to other alignments using the sum-of-pairs metric.

lagan ile İlgili Diğer Paketler

• dep: libc6 (>= 2.34) [alpha, arm64, ia64, sh4 değil]

  GNU C Library: Shared libraries
  ayrıca şunun tarafından sağlanan bir sanal paket libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.38) [arm64]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU C Library: Shared libraries
  ayrıca şunun tarafından sağlanan bir sanal paket libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

  GCC support library

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC support library

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC support library

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  GNU Standard C++ Library v3

• dep: libunwind8 [ia64]

  library to determine the call-chain of a program - runtime

lagan indir

Tüm mevcut mimariler için indir

Mimari	Sürüm	Paket Boyutu	Kurulu Boyut	Dosyalar
alpha (resmi olmayan port)	2.0-10	178,8 kB	1.898,0 kB	[dosya listesi]
amd64	2.0-10	179,9 kB	834,0 kB	[dosya listesi]
arm64	2.0-10+b1	173,2 kB	1.771,0 kB	[dosya listesi]
armel	2.0-10	163,2 kB	691,0 kB	[dosya listesi]
armhf	2.0-10	162,4 kB	583,0 kB	[dosya listesi]
hppa (resmi olmayan port)	2.0-10	174,6 kB	716,0 kB	[dosya listesi]
i386	2.0-10	186,7 kB	831,0 kB	[dosya listesi]
ia64 (resmi olmayan port)	2.0-10	213,5 kB	1.035,0 kB	[dosya listesi]
m68k (resmi olmayan port)	2.0-10	155,6 kB	683,0 kB	[dosya listesi]
mips64el	2.0-10	182,3 kB	1.924,0 kB	[dosya listesi]
ppc64 (resmi olmayan port)	2.0-10	190,5 kB	2.034,0 kB	[dosya listesi]
ppc64el	2.0-10	199,0 kB	1.898,0 kB	[dosya listesi]
riscv64	2.0-10	180,8 kB	682,0 kB	[dosya listesi]
s390x	2.0-10	186,6 kB	802,0 kB	[dosya listesi]
sh4 (resmi olmayan port)	2.0-10	179,3 kB	1.747,0 kB	[dosya listesi]
sparc64 (resmi olmayan port)	2.0-10	166,3 kB	23.868,0 kB	[dosya listesi]
x32 (resmi olmayan port)	2.0-10	174,9 kB	796,0 kB	[dosya listesi]