Пакет: lagan (2.0-10 и другие)

[ Источник: lagan  ]

highly parametrizable pairwise global genome sequence aligner

Lagan takes local alignments generated by CHAOS as anchors, and limits the search area of the Needleman-Wunsch algorithm around these anchors.

Multi-LAGAN is a generalization of the pairwise algorithm to multiple sequence alignment. M-LAGAN performs progressive pairwise alignments, guided by a user-specified phylogenetic tree. Alignments are aligned to other alignments using the sum-of-pairs metric.

Другие пакеты, относящиеся к lagan

• dep: libc6 (>= 2.34) [не alpha, arm64, ia64, sh4]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.38) [arm64]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

  вспомогательная библиотека GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  вспомогательная библиотека GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  вспомогательная библиотека GCC

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  стандартная библиотека GNU C++ версии 3

• dep: libunwind8 [ia64]

  библиотека для выявления цепочки вызовов функций в программе

Загрузка lagan

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Версия	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
alpha (неофициальный перенос)	2.0-10	178,8 Кб	1 898,0 Кб	[список файлов]
amd64	2.0-10	179,9 Кб	834,0 Кб	[список файлов]
arm64	2.0-10+b1	173,2 Кб	1 771,0 Кб	[список файлов]
armel	2.0-10	163,2 Кб	691,0 Кб	[список файлов]
armhf	2.0-10	162,4 Кб	583,0 Кб	[список файлов]
hppa (неофициальный перенос)	2.0-10	174,6 Кб	716,0 Кб	[список файлов]
i386	2.0-10	186,7 Кб	831,0 Кб	[список файлов]
ia64 (неофициальный перенос)	2.0-10	213,5 Кб	1 035,0 Кб	[список файлов]
m68k (неофициальный перенос)	2.0-10	155,6 Кб	683,0 Кб	[список файлов]
mips64el	2.0-10	182,3 Кб	1 924,0 Кб	[список файлов]
ppc64 (неофициальный перенос)	2.0-10	190,5 Кб	2 034,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	2.0-10	199,0 Кб	1 898,0 Кб	[список файлов]
riscv64	2.0-10	180,8 Кб	682,0 Кб	[список файлов]
s390x	2.0-10	186,6 Кб	802,0 Кб	[список файлов]
sh4 (неофициальный перенос)	2.0-10	179,3 Кб	1 747,0 Кб	[список файлов]
sparc64 (неофициальный перенос)	2.0-10	166,3 Кб	23 868,0 Кб	[список файлов]
x32 (неофициальный перенос)	2.0-10	174,9 Кб	796,0 Кб	[список файлов]