[ ソース: lagan ]
パッケージ: lagan (2.0-10 など)
highly parametrizable pairwise global genome sequence aligner
Lagan takes local alignments generated by CHAOS as anchors, and limits the search area of the Needleman-Wunsch algorithm around these anchors.
Multi-LAGAN is a generalization of the pairwise algorithm to multiple sequence alignment. M-LAGAN performs progressive pairwise alignments, guided by a user-specified phylogenetic tree. Alignments are aligned to other alignments using the sum-of-pairs metric.
その他の lagan 関連パッケージ
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- dep: libc6 (>= 2.34) [alpha, arm64, ia64, loong64, sh4 以外]
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.37) [loong64, sh4]
- dep: libc6 (>= 2.38) [arm64]
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- dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6.1-udeb
- dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
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- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, loong64, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]
- GCC 共有ライブラリ
- dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]
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- dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]
- GCC 共有ライブラリ
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- dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]
- GCC 共有ライブラリ
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- dep: libstdc++6 (>= 13.1)
- GNU 標準 C++ ライブラリ v3
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- dep: libunwind8 [ia64]
- プログラムのコールチェーン測定ライブラリ - ランタイム版
lagan のダウンロード
| アーキテクチャ | バージョン | パッケージサイズ | インストールサイズ | ファイル |
|---|---|---|---|---|
| alpha (非公式の移植版) | 2.0-10 | 178.8 kB | 1,898.0 kB | [ファイル一覧] |
| amd64 | 2.0-10 | 179.9 kB | 834.0 kB | [ファイル一覧] |
| arm64 | 2.0-10+b2 | 173.8 kB | 1,771.0 kB | [ファイル一覧] |
| armel | 2.0-10 | 163.2 kB | 691.0 kB | [ファイル一覧] |
| armhf | 2.0-10 | 162.4 kB | 583.0 kB | [ファイル一覧] |
| hppa (非公式の移植版) | 2.0-10 | 174.6 kB | 716.0 kB | [ファイル一覧] |
| i386 | 2.0-10 | 186.7 kB | 831.0 kB | [ファイル一覧] |
| ia64 (非公式の移植版) | 2.0-10 | 213.5 kB | 1,035.0 kB | [ファイル一覧] |
| loong64 (非公式の移植版) | 2.0-10 | 173.5 kB | 890.0 kB | [ファイル一覧] |
| m68k (非公式の移植版) | 2.0-10 | 155.6 kB | 683.0 kB | [ファイル一覧] |
| mips64el | 2.0-10 | 182.3 kB | 1,924.0 kB | [ファイル一覧] |
| ppc64 (非公式の移植版) | 2.0-10 | 190.5 kB | 2,034.0 kB | [ファイル一覧] |
| ppc64el | 2.0-10 | 199.0 kB | 1,898.0 kB | [ファイル一覧] |
| riscv64 | 2.0-10 | 180.8 kB | 682.0 kB | [ファイル一覧] |
| s390x | 2.0-10 | 186.6 kB | 802.0 kB | [ファイル一覧] |
| sh4 (非公式の移植版) | 2.0-10 | 179.3 kB | 1,747.0 kB | [ファイル一覧] |
| sparc64 (非公式の移植版) | 2.0-10 | 166.3 kB | 23,868.0 kB | [ファイル一覧] |
| x32 (非公式の移植版) | 2.0-10 | 174.9 kB | 796.0 kB | [ファイル一覧] |