Paquet : lagan (2.0-10)

[ Paquet source : lagan  ]

alignement global de séquences génomiques par paire, hautement paramétrable

Lagan prend des alignements locaux générés par CHAOS comme ancres et limite la zone de recherche de l’algorithme de Needleman-Wunsch aux alentours de ces ancres.

Multi-LAGAN est une généralisation de l’algorithme d’alignement multiple par paire de séquences. M-LAGAN réalise des alignements progressifs par paire contrôlés par un arbre phylogénétique spécifié par l’utilisateur. Les alignements sont alignés avec d’autres alignements en utilisant une métrique de somme des paires.

Autres paquets associés à lagan

• dep: libc6 (>= 2.34) [non alpha, ia64, sh4]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  bibliothèque standard C++ de GNU v3

• dep: libunwind8 [ia64]

  bibliothèque pour déterminer la chaîne d'appel d'un programme –⋅exécutable

Télécharger lagan

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
alpha (portage non officiel)	178,8 ko	1 898,0 ko	[liste des fichiers]
amd64	179,9 ko	834,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	170,4 ko	1 770,0 ko	[liste des fichiers]
armel	163,2 ko	691,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	162,4 ko	583,0 ko	[liste des fichiers]
hppa (portage non officiel)	174,6 ko	716,0 ko	[liste des fichiers]
i386	186,7 ko	831,0 ko	[liste des fichiers]
ia64 (portage non officiel)	213,5 ko	1 035,0 ko	[liste des fichiers]
m68k (portage non officiel)	155,6 ko	683,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	182,3 ko	1 924,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64 (portage non officiel)	190,5 ko	2 034,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	199,0 ko	1 898,0 ko	[liste des fichiers]
riscv64	180,8 ko	682,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	186,6 ko	802,0 ko	[liste des fichiers]
sh4 (portage non officiel)	179,3 ko	1 747,0 ko	[liste des fichiers]
sparc64 (portage non officiel)	166,3 ko	23 868,0 ko	[liste des fichiers]
x32 (portage non officiel)	174,9 ko	796,0 ko	[liste des fichiers]