Paket: lagan (2.0-10 och andra)

[ Källkod: lagan  ]

highly parametrizable pairwise global genome sequence aligner

Lagan takes local alignments generated by CHAOS as anchors, and limits the search area of the Needleman-Wunsch algorithm around these anchors.

Multi-LAGAN is a generalization of the pairwise algorithm to multiple sequence alignment. M-LAGAN performs progressive pairwise alignments, guided by a user-specified phylogenetic tree. Alignments are aligned to other alignments using the sum-of-pairs metric.

Andra paket besläktade med lagan

• dep: libc6 (>= 2.34) [ej arm64]

  GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
  också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.38) [arm64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [ej armel, armhf, riscv64]

  GCC stödbibliotek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [riscv64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  GNU standardbibliotek v3 för C++

Hämta lagan

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer

Arkitektur	Version	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
amd64	2.0-10	179,9 kbyte	834,0 kbyte	[filförteckning]
arm64	2.0-10+b2	173,8 kbyte	1.771,0 kbyte	[filförteckning]
armel	2.0-10	163,2 kbyte	691,0 kbyte	[filförteckning]
armhf	2.0-10	162,4 kbyte	583,0 kbyte	[filförteckning]
i386	2.0-10	186,7 kbyte	831,0 kbyte	[filförteckning]
mips64el	2.0-10	182,3 kbyte	1.924,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64el	2.0-10	199,0 kbyte	1.898,0 kbyte	[filförteckning]
riscv64	2.0-10	180,8 kbyte	682,0 kbyte	[filförteckning]
s390x	2.0-10	186,6 kbyte	802,0 kbyte	[filförteckning]