Balík: probalign (1.4-10)

[ Zdroj: probalign  ]

multiple sequence alignment using partition function posterior probabilities

Probalign uses partition function posterior probability estimates to compute maximum expected accuracy multiple sequence alignments. It performs statistically significantly better than the leading alignment programs Probcons v1.1, MAFFT v5.851, and MUSCLE v3.6 on BAliBASE 3.0, HOMSTRAD, and OXBENCH benchmarks. Probalign improvements are largest on datasets containing N/C terminal extensions and on datasets with long and heterogeneous length sequences. On heteregeneous length datasets containing repeats Probalign alignment accuracy is 10% and 15% higher than the other three methods when standard deviation of length is at least 300 and 400.

Ostatné balíky súvisiace s balíkom probalign

• dep: libc6 (>= 2.34)

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nie armel, armhf, ppc64el]

  podporná knižnica GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64el]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 11)

  štandardná knižnica C++ GNU v3

Stiahnuť probalign

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
amd64	68.9 kB	175.0 kB	[zoznam súborov]
arm64	64.6 kB	219.0 kB	[zoznam súborov]
armel	55.1 kB	142.0 kB	[zoznam súborov]
armhf	53.9 kB	114.0 kB	[zoznam súborov]
i386	61.4 kB	158.0 kB	[zoznam súborov]
mips64el	65.4 kB	223.0 kB	[zoznam súborov]
mipsel	64.2 kB	221.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64el	78.4 kB	219.0 kB	[zoznam súborov]
s390x	56.7 kB	171.0 kB	[zoznam súborov]