Balík: murasaki (1.68.6-14 a iné)

[ Zdroj: murasaki  ]

homology detection tool across multiple large genomes

Murasaki is a scalable and fast, language theory-based homology detection tool across multiple large genomes. It enable whole-genome scale multiple genome global alignments. Supports unlimited length gapped-seed patterns and unique TF-IDF based filtering.

Murasaki is an anchor alignment software, which is

 * exteremely fast (17 CPU hours for whole Human x Mouse genome (with
   40 nodes: 52 wall minutes))
 * scalable (Arbitrarily parallelizable across multiple nodes using MPI.
   Even a single node with 16GB of ram can handle over 1Gbp of sequence.)
 * unlimited pattern length
 * repeat tolerant
 * intelligent noise reduction

Ostatné balíky súvisiace s balíkom murasaki

• dep: libboost-filesystem1.83.0 (>= 1.83.0)

  operácie so súborovým systémom (portabilné cesty, prechádzanie adresárov atď.) v C++

• dep: libboost-iostreams1.83.0 (>= 1.83.0)

  knižnica Boost.Iostreams

• dep: libc6 (>= 2.38) [nie alpha, ia64, loong64, sh4]

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.40) [loong64, sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, loong64, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

  podporná knižnica GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  podporná knižnica GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  podporná knižnica GCC

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [ia64, m68k]

  štandardná knižnica C++ GNU v3

  dep: libstdc++6 (>= 14) [nie ia64, m68k]

• dep: libunwind8 [ia64]

  nnižnica na určenie na určenie postupnosti volania programu - dynamické súbory

• dep: murasaki-common

  homology detection tool across multiple large genomes (common files)

Stiahnuť murasaki

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Verzia	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
alpha (neoficiálny port)	1.68.6-14+b1	597.4 kB	4,978.0 kB	[zoznam súborov]
amd64	1.68.6-14+b1	629.6 kB	4,400.0 kB	[zoznam súborov]
arm64	1.68.6-14+b1	543.3 kB	4,319.0 kB	[zoznam súborov]
armel	1.68.6-14	452.9 kB	3,326.0 kB	[zoznam súborov]
armhf	1.68.6-14	462.8 kB	2,350.0 kB	[zoznam súborov]
hppa (neoficiálny port)	1.68.6-14	586.1 kB	3,991.0 kB	[zoznam súborov]
i386	1.68.6-14	638.5 kB	4,166.0 kB	[zoznam súborov]
ia64 (neoficiálny port)	1.68.6-13+b5	658.9 kB	8,435.0 kB	[zoznam súborov]
loong64 (neoficiálny port)	1.68.6-14+b1	575.0 kB	4,398.0 kB	[zoznam súborov]
m68k (neoficiálny port)	1.68.6-14	483.4 kB	3,566.0 kB	[zoznam súborov]
mips64el	1.68.6-14+b1	596.1 kB	5,866.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64 (neoficiálny port)	1.68.6-14+b1	603.4 kB	5,792.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64el	1.68.6-14+b1	606.8 kB	5,600.0 kB	[zoznam súborov]
riscv64	1.68.6-14+b1	584.6 kB	3,203.0 kB	[zoznam súborov]
s390x	1.68.6-14+b1	606.9 kB	4,827.0 kB	[zoznam súborov]
sh4 (neoficiálny port)	1.68.6-14	515.2 kB	3,657.0 kB	[zoznam súborov]
sparc64 (neoficiálny port)	1.68.6-14+b1	506.6 kB	13,459.0 kB	[zoznam súborov]
x32 (neoficiálny port)	1.68.6-14	602.5 kB	3,978.0 kB	[zoznam súborov]