Paket: murasaki (1.68.6-14 och andra)

[ Källkod: murasaki  ]

homology detection tool across multiple large genomes

Murasaki is a scalable and fast, language theory-based homology detection tool across multiple large genomes. It enable whole-genome scale multiple genome global alignments. Supports unlimited length gapped-seed patterns and unique TF-IDF based filtering.

Murasaki is an anchor alignment software, which is

 * exteremely fast (17 CPU hours for whole Human x Mouse genome (with
   40 nodes: 52 wall minutes))
 * scalable (Arbitrarily parallelizable across multiple nodes using MPI.
   Even a single node with 16GB of ram can handle over 1Gbp of sequence.)
 * unlimited pattern length
 * repeat tolerant
 * intelligent noise reduction

Andra paket besläktade med murasaki

• dep: libboost-filesystem1.83.0 (>= 1.83.0)

  filesystem operations (portable paths, iteration over directories, etc) in C++

• dep: libboost-iostreams1.83.0 (>= 1.83.0)

  Boost.Iostreams Library

• dep: libc6 (>= 2.38) [ej alpha, ia64, loong64, sh4]

  GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
  också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.40) [loong64, sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

  GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
  också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, loong64, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

  GCC stödbibliotek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC stödbibliotek

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC stödbibliotek

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [ia64, m68k]

  GNU standardbibliotek v3 för C++

  dep: libstdc++6 (>= 14) [ej ia64, m68k]

• dep: libunwind8 [ia64]

  library to determine the call-chain of a program - runtime

• dep: murasaki-common

  homology detection tool across multiple large genomes (common files)

Hämta murasaki

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer

Arkitektur	Version	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
alpha (inofficiell anpassning)	1.68.6-14+b1	597,4 kbyte	4.978,0 kbyte	[filförteckning]
amd64	1.68.6-14+b1	629,6 kbyte	4.400,0 kbyte	[filförteckning]
arm64	1.68.6-14+b1	543,3 kbyte	4.319,0 kbyte	[filförteckning]
armel	1.68.6-14	452,9 kbyte	3.326,0 kbyte	[filförteckning]
armhf	1.68.6-14	462,8 kbyte	2.350,0 kbyte	[filförteckning]
hppa (inofficiell anpassning)	1.68.6-14	586,1 kbyte	3.991,0 kbyte	[filförteckning]
i386	1.68.6-14	638,5 kbyte	4.166,0 kbyte	[filförteckning]
ia64 (inofficiell anpassning)	1.68.6-13+b5	658,9 kbyte	8.435,0 kbyte	[filförteckning]
loong64 (inofficiell anpassning)	1.68.6-14+b1	575,0 kbyte	4.398,0 kbyte	[filförteckning]
m68k (inofficiell anpassning)	1.68.6-14	483,4 kbyte	3.566,0 kbyte	[filförteckning]
mips64el	1.68.6-14+b1	596,1 kbyte	5.866,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64 (inofficiell anpassning)	1.68.6-14+b1	603,4 kbyte	5.792,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64el	1.68.6-14+b1	606,8 kbyte	5.600,0 kbyte	[filförteckning]
riscv64	1.68.6-14+b1	584,6 kbyte	3.203,0 kbyte	[filförteckning]
s390x	1.68.6-14+b1	606,9 kbyte	4.827,0 kbyte	[filförteckning]
sh4 (inofficiell anpassning)	1.68.6-14	515,2 kbyte	3.657,0 kbyte	[filförteckning]
sparc64 (inofficiell anpassning)	1.68.6-14+b1	506,6 kbyte	13.459,0 kbyte	[filförteckning]
x32 (inofficiell anpassning)	1.68.6-14	602,5 kbyte	3.978,0 kbyte	[filförteckning]