Pakiet: murasaki (1.68.6-14 i inne)

[ Pakiet źródłowy: murasaki  ]

homology detection tool across multiple large genomes

Murasaki is a scalable and fast, language theory-based homology detection tool across multiple large genomes. It enable whole-genome scale multiple genome global alignments. Supports unlimited length gapped-seed patterns and unique TF-IDF based filtering.

Murasaki is an anchor alignment software, which is

 * exteremely fast (17 CPU hours for whole Human x Mouse genome (with
   40 nodes: 52 wall minutes))
 * scalable (Arbitrarily parallelizable across multiple nodes using MPI.
   Even a single node with 16GB of ram can handle over 1Gbp of sequence.)
 * unlimited pattern length
 * repeat tolerant
 * intelligent noise reduction

Inne pakiety związane z murasaki

• dep: libboost-filesystem1.83.0 (>= 1.83.0)

  filesystem operations (portable paths, iteration over directories, etc) in C++

• dep: libboost-iostreams1.83.0 (>= 1.83.0)

  Biblioteka Boost.Iostreams

• dep: libc6 (>= 2.38) [nie alpha, ia64, loong64, sh4]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.40) [loong64, sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, loong64, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

  Biblioteka wspomagająca GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  Biblioteka wspomagająca GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  Biblioteka wspomagająca GCC

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [ia64, m68k]

  Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

  dep: libstdc++6 (>= 14) [nie ia64, m68k]

• dep: libunwind8 [ia64]

  Biblioteka do ustalania łańcucha wywołań programu - środowisko uruchomieniowe

• dep: murasaki-common

  homology detection tool across multiple large genomes (common files)

Pobieranie murasaki

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
alpha (port nieoficjalny)	1.68.6-14+b1	597,4 KiB	4 978,0 KiB	[lista plików]
amd64	1.68.6-14+b1	629,6 KiB	4 400,0 KiB	[lista plików]
arm64	1.68.6-14+b1	543,3 KiB	4 319,0 KiB	[lista plików]
armel	1.68.6-14	452,9 KiB	3 326,0 KiB	[lista plików]
armhf	1.68.6-14	462,8 KiB	2 350,0 KiB	[lista plików]
hppa (port nieoficjalny)	1.68.6-14	586,1 KiB	3 991,0 KiB	[lista plików]
i386	1.68.6-14	638,5 KiB	4 166,0 KiB	[lista plików]
ia64 (port nieoficjalny)	1.68.6-13+b5	658,9 KiB	8 435,0 KiB	[lista plików]
loong64 (port nieoficjalny)	1.68.6-14+b1	575,0 KiB	4 398,0 KiB	[lista plików]
m68k (port nieoficjalny)	1.68.6-14	483,4 KiB	3 566,0 KiB	[lista plików]
mips64el	1.68.6-14+b1	596,1 KiB	5 866,0 KiB	[lista plików]
ppc64 (port nieoficjalny)	1.68.6-14+b1	603,4 KiB	5 792,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	1.68.6-14+b1	606,8 KiB	5 600,0 KiB	[lista plików]
riscv64	1.68.6-14+b1	584,6 KiB	3 203,0 KiB	[lista plików]
s390x	1.68.6-14+b1	606,9 KiB	4 827,0 KiB	[lista plików]
sh4 (port nieoficjalny)	1.68.6-14	515,2 KiB	3 657,0 KiB	[lista plików]
sparc64 (port nieoficjalny)	1.68.6-14+b1	506,6 KiB	13 459,0 KiB	[lista plików]
x32 (port nieoficjalny)	1.68.6-14	602,5 KiB	3 978,0 KiB	[lista plików]