パッケージ: murasaki (1.68.6-14 など)

murasaki に関するリンク

Debian の資源:

murasaki ソースパッケージをダウンロード:

メンテナ:

外部の資源:

ホームページ [murasaki.dna.bio.keio.ac.jp]

類似のパッケージ:

homology detection tool across multiple large genomes

Murasaki is a scalable and fast, language theory-based homology detection tool across multiple large genomes. It enable whole-genome scale multiple genome global alignments. Supports unlimited length gapped-seed patterns and unique TF-IDF based filtering.

Murasaki is an anchor alignment software, which is

 * exteremely fast (17 CPU hours for whole Human x Mouse genome (with
   40 nodes: 52 wall minutes))
 * scalable (Arbitrarily parallelizable across multiple nodes using MPI.
   Even a single node with 16GB of ram can handle over 1Gbp of sequence.)
 * unlimited pattern length
 * repeat tolerant
 * intelligent noise reduction

その他の murasaki 関連パッケージ

依存

推奨

提案

enhances

dep: libboost-filesystem1.83.0 (>= 1.83.0)

C++ でのファイルシステム操作 (ポータブルなパス、ディレクトリの列挙など)
dep: libboost-iostreams1.83.0 (>= 1.83.0)

Boost.Iostreams ライブラリ
dep: libc6 (>= 2.38) [alpha, ia64, sh4 以外]

GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]
dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

GCC 共有ライブラリ

dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]
dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

GCC 共有ライブラリ
dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

GCC 共有ライブラリ
dep: libstdc++6 (>= 13.1) [ia64, m68k]

GNU 標準 C++ ライブラリ v3

dep: libstdc++6 (>= 14) [ia64, m68k 以外]
dep: libunwind8 [ia64]

プログラムのコールチェーン測定ライブラリ - ランタイム版
dep: murasaki-common

homology detection tool across multiple large genomes (common files)

murasaki のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード
アーキテクチャ	バージョン	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
alpha (非公式の移植版)	1.68.6-14+b1	597.4 kB	4,978.0 kB	[ファイル一覧]
amd64	1.68.6-14+b1	629.6 kB	4,400.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	1.68.6-14+b1	543.3 kB	4,319.0 kB	[ファイル一覧]
armel	1.68.6-14	452.9 kB	3,326.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	1.68.6-14	462.8 kB	2,350.0 kB	[ファイル一覧]
hppa (非公式の移植版)	1.68.6-14	586.1 kB	3,991.0 kB	[ファイル一覧]
i386	1.68.6-14	638.5 kB	4,166.0 kB	[ファイル一覧]
ia64 (非公式の移植版)	1.68.6-13+b5	658.9 kB	8,435.0 kB	[ファイル一覧]
m68k (非公式の移植版)	1.68.6-14	483.4 kB	3,566.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	1.68.6-14+b1	596.1 kB	5,866.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64 (非公式の移植版)	1.68.6-14+b1	603.4 kB	5,792.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	1.68.6-14+b1	606.8 kB	5,600.0 kB	[ファイル一覧]
riscv64	1.68.6-14+b1	584.6 kB	3,203.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	1.68.6-14+b1	606.9 kB	4,827.0 kB	[ファイル一覧]
sh4 (非公式の移植版)	1.68.6-14	515.2 kB	3,657.0 kB	[ファイル一覧]
sparc64 (非公式の移植版)	1.68.6-14+b1	506.6 kB	13,459.0 kB	[ファイル一覧]
x32 (非公式の移植版)	1.68.6-14	602.5 kB	3,978.0 kB	[ファイル一覧]