Balík: murasaki (1.68.6-12)

[ Zdroj: murasaki  ]

homology detection tool across multiple large genomes

Murasaki is a scalable and fast, language theory-based homology detection tool across multiple large genomes. It enable whole-genome scale multiple genome global alignments. Supports unlimited length gapped-seed patterns and unique TF-IDF based filtering.

Murasaki is an anchor alignment software, which is

 * exteremely fast (17 CPU hours for whole Human x Mouse genome (with
   40 nodes: 52 wall minutes))
 * scalable (Arbitrarily parallelizable across multiple nodes using MPI.
   Even a single node with 16GB of ram can handle over 1Gbp of sequence.)
 * unlimited pattern length
 * repeat tolerant
 * intelligent noise reduction

Ostatné balíky súvisiace s balíkom murasaki

• dep: libboost-filesystem1.74.0 (>= 1.74.0)

  operácie so súborovým systémom (portabilné cesty, prechádzanie adresárov atď.) v C++

• dep: libboost-iostreams1.74.0 (>= 1.74.0)

  knižnica Boost.Iostreams

• dep: libboost-regex1.74.0-icu67

  virtuálny balík poskytovaný balíkom libboost-regex1.74.0

• dep: libc6 (>= 2.29)

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nie armel, armhf, i386, mipsel]

  podporná knižnica GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, mipsel]

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  štandardná knižnica C++ GNU v3

• dep: murasaki-common

  homology detection tool across multiple large genomes (common files)

Stiahnuť murasaki

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
amd64	509.4 kB	3,247.0 kB	[zoznam súborov]
arm64	445.1 kB	2,871.0 kB	[zoznam súborov]
armel	369.5 kB	2,377.0 kB	[zoznam súborov]
armhf	378.9 kB	1,689.0 kB	[zoznam súborov]
i386	526.6 kB	3,105.0 kB	[zoznam súborov]
mips64el	481.2 kB	3,955.0 kB	[zoznam súborov]
mipsel	474.4 kB	3,599.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64el	504.5 kB	4,235.0 kB	[zoznam súborov]
s390x	451.1 kB	3,355.0 kB	[zoznam súborov]