软件包：murasaki（1.68.6-14 以及其他的）

[ 源代码： murasaki  ]

homology detection tool across multiple large genomes

Murasaki is a scalable and fast, language theory-based homology detection tool across multiple large genomes. It enable whole-genome scale multiple genome global alignments. Supports unlimited length gapped-seed patterns and unique TF-IDF based filtering.

Murasaki is an anchor alignment software, which is

 * exteremely fast (17 CPU hours for whole Human x Mouse genome (with
   40 nodes: 52 wall minutes))
 * scalable (Arbitrarily parallelizable across multiple nodes using MPI.
   Even a single node with 16GB of ram can handle over 1Gbp of sequence.)
 * unlimited pattern length
 * repeat tolerant
 * intelligent noise reduction

其他与 murasaki 有关的软件包

• dep: libboost-filesystem1.83.0 (>= 1.83.0)

  filesystem operations (portable paths, iteration over directories, etc) in C++

• dep: libboost-iostreams1.83.0 (>= 1.83.0)

  Boost.Iostream 软件库

• dep: libc6 (>= 2.38) [除 alpha, ia64, sh4]

  GNU C 语言运行库：共享库
  同时作为一个虚包由这些包填实： libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

  GNU C 语言运行库：共享库
  同时作为一个虚包由这些包填实： libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

  GCC 支持库

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC 支持库

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC 支持库

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [ia64, m68k]

  GNU 标准 C++ 库，第3版

  dep: libstdc++6 (>= 14) [除 ia64, m68k]

• dep: libunwind8 [ia64]

  library to determine the call-chain of a program - runtime

• dep: murasaki-common

  homology detection tool across multiple large genomes (common files)

下载 murasaki

下载可用于所有硬件架构的

硬件架构	版本	软件包大小	安装后大小	文件
alpha （非官方移植版）	1.68.6-14+b1	597.4 kB	4,978.0 kB	[文件列表]
amd64	1.68.6-14+b1	629.6 kB	4,400.0 kB	[文件列表]
arm64	1.68.6-14+b1	543.3 kB	4,319.0 kB	[文件列表]
armel	1.68.6-14	452.9 kB	3,326.0 kB	[文件列表]
armhf	1.68.6-14	462.8 kB	2,350.0 kB	[文件列表]
hppa （非官方移植版）	1.68.6-14	586.1 kB	3,991.0 kB	[文件列表]
i386	1.68.6-14	638.5 kB	4,166.0 kB	[文件列表]
ia64 （非官方移植版）	1.68.6-13+b5	658.9 kB	8,435.0 kB	[文件列表]
m68k （非官方移植版）	1.68.6-14	483.4 kB	3,566.0 kB	[文件列表]
mips64el	1.68.6-14+b1	596.1 kB	5,866.0 kB	[文件列表]
ppc64 （非官方移植版）	1.68.6-14+b1	603.4 kB	5,792.0 kB	[文件列表]
ppc64el	1.68.6-14+b1	606.8 kB	5,600.0 kB	[文件列表]
riscv64	1.68.6-14+b1	584.6 kB	3,203.0 kB	[文件列表]
s390x	1.68.6-14+b1	606.9 kB	4,827.0 kB	[文件列表]
sh4 （非官方移植版）	1.68.6-14	515.2 kB	3,657.0 kB	[文件列表]
sparc64 （非官方移植版）	1.68.6-14+b1	506.6 kB	13,459.0 kB	[文件列表]
x32 （非官方移植版）	1.68.6-14	602.5 kB	3,978.0 kB	[文件列表]