Pacote: murasaki (1.68.6-14 e outros)

[ Fonte: murasaki  ]

homology detection tool across multiple large genomes

Murasaki is a scalable and fast, language theory-based homology detection tool across multiple large genomes. It enable whole-genome scale multiple genome global alignments. Supports unlimited length gapped-seed patterns and unique TF-IDF based filtering.

Murasaki is an anchor alignment software, which is

 * exteremely fast (17 CPU hours for whole Human x Mouse genome (with
   40 nodes: 52 wall minutes))
 * scalable (Arbitrarily parallelizable across multiple nodes using MPI.
   Even a single node with 16GB of ram can handle over 1Gbp of sequence.)
 * unlimited pattern length
 * repeat tolerant
 * intelligent noise reduction

Outros pacotes relacionados a murasaki

• dep: libboost-filesystem1.83.0 (>= 1.83.0)

  filesystem operations (portable paths, iteration over directories, etc) in C++

• dep: libboost-iostreams1.83.0 (>= 1.83.0)

  biblioteca Boost.Iostreams

• dep: libc6 (>= 2.38) [não alpha, ia64, loong64, sh4]

  GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
  também um pacote virtual fornecido por libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.40) [loong64, sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

  GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
  também um pacote virtual fornecido por libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, loong64, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

  Biblioteca de suporte GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  Biblioteca de suporte GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  Biblioteca de suporte GCC

• dep: libstdc++6 (>= 13.1) [ia64, m68k]

  Biblioteca C++ padrão da GNU v3

  dep: libstdc++6 (>= 14) [não ia64, m68k]

• dep: libunwind8 [ia64]

  biblioteca para determinar a cadeia de chamadas de um programa - execução

• dep: murasaki-common

  homology detection tool across multiple large genomes (common files)

Download de murasaki

Baixe para todas as arquiteturas disponíveis

Arquitetura	Versão	Tamanho do pacote	Tamanho instalado	Arquivos
alpha (porte não oficial)	1.68.6-14+b1	597.4 kB	4,978.0 kB	[lista de arquivos]
amd64	1.68.6-14+b1	629.6 kB	4,400.0 kB	[lista de arquivos]
arm64	1.68.6-14+b1	543.3 kB	4,319.0 kB	[lista de arquivos]
armel	1.68.6-14	452.9 kB	3,326.0 kB	[lista de arquivos]
armhf	1.68.6-14	462.8 kB	2,350.0 kB	[lista de arquivos]
hppa (porte não oficial)	1.68.6-14	586.1 kB	3,991.0 kB	[lista de arquivos]
i386	1.68.6-14	638.5 kB	4,166.0 kB	[lista de arquivos]
ia64 (porte não oficial)	1.68.6-13+b5	658.9 kB	8,435.0 kB	[lista de arquivos]
loong64 (porte não oficial)	1.68.6-14+b1	575.0 kB	4,398.0 kB	[lista de arquivos]
m68k (porte não oficial)	1.68.6-14	483.4 kB	3,566.0 kB	[lista de arquivos]
mips64el	1.68.6-14+b1	596.1 kB	5,866.0 kB	[lista de arquivos]
ppc64 (porte não oficial)	1.68.6-14+b1	603.4 kB	5,792.0 kB	[lista de arquivos]
ppc64el	1.68.6-14+b1	606.8 kB	5,600.0 kB	[lista de arquivos]
riscv64	1.68.6-14+b1	584.6 kB	3,203.0 kB	[lista de arquivos]
s390x	1.68.6-14+b1	606.9 kB	4,827.0 kB	[lista de arquivos]
sh4 (porte não oficial)	1.68.6-14	515.2 kB	3,657.0 kB	[lista de arquivos]
sparc64 (porte não oficial)	1.68.6-14+b1	506.6 kB	13,459.0 kB	[lista de arquivos]
x32 (porte não oficial)	1.68.6-14	602.5 kB	3,978.0 kB	[lista de arquivos]