Paketti: tabix (1.20+ds-1)

[ Source: htslib  ]

generic indexer for TAB-delimited genome position files

Tabix indexes files where some columns indicate sequence coordinates: name (usually a chromosome), start and stop. The input data file must be position sorted and compressed by bgzip (provided in this package), which has a gzip like interface. After indexing, tabix is able to quickly retrieve data lines by chromosomal coordinates. Fast data retrieval also works over network if an URI is given as a file name.

This package is built from the HTSlib source, and provides the bgzip, htsfile, and tabix tools.

Tagit: Implemented in: C, Role: Program, Tiede: science::calculation, use::calculating, Supports Format: HTML, Hypertext Markup Language, Works with: Text

Muut pakettiin tabix liittyvät paketit

• dep: libbz2-1.0

  high-quality block-sorting file compressor library - runtime

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

• dep: libdeflate0 (>= 1.0)

  fast, whole-buffer DEFLATE-based compression and decompression

• dep: libhtscodecs2 (>= 1.3.0)

  Custom compression for CRAM and others

• dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20120614)

  XZ-tiedostomuodon pakkauskirjasto

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  pakkauskirjaston ajonaikaistiedostot

Imuroi tabix

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille

Arkkitehtuuri	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
amd64	471.4 kt	2,249.0 kt	[tiedostoluettelo]
arm64	438.8 kt	2,249.0 kt	[tiedostoluettelo]
armel	401.4 kt	2,062.0 kt	[tiedostoluettelo]
armhf	404.8 kt	1,494.0 kt	[tiedostoluettelo]
i386	517.3 kt	2,566.0 kt	[tiedostoluettelo]
mips64el	430.6 kt	2,618.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64el	508.1 kt	3,017.0 kt	[tiedostoluettelo]
riscv64	488.8 kt	1,893.0 kt	[tiedostoluettelo]
s390x	462.5 kt	2,465.0 kt	[tiedostoluettelo]