wszystkie opcje
buster  ] [  bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Pakiet źródłowy: htslib  ]

Pakiet: tabix (1.20+ds-1 i inne)

Odnośniki dla tabix

Screenshot

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego htslib:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Podobne pakiety:

Narzędzie do indeksowania plików z tabulacjami rozdzielającymi pozycje genomu

Tabix indeksuje pliki, w których kolejność współrzędnych jest wskazywana przez niektóre kolumny, takie jak: name (zwykle z nazwą chromosomu), start i stop. Plik z danymi wejściowymi powinien być posortowany pod kątem pozycji (genomów) oraz skompresowany przy użyciu programu bgzip (dostarczonego w tym pakiecie), oferującego interfejs podobny do gzip. Po wykonaniu operacji indeksowania, Tabix może szybko wyszukiwać linie danych według współrzędnych chromosomalnych. Szybkie wyszukiwanie danych działa także za pośrednictwem sieci, jeśli URI jest podany jako nazwa pliku.

Do budowy pakietu wykorzystano kod źródłowy HTSlib. Pakiet zawiera następujące narzędzia: bgzip, htsfile i tabix.

Znaczniki: Zaimplementowane w: C, Rola: Program, Nauka: science::calculation, use::calculating, Obsługa formatu: HTML - Hypertext Markup Language, Działa z: Tekst

Inne pakiety związane z tabix

  • wymaga
  • poleca
  • sugeruje
  • enhances

Pobieranie tabix

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura Wersja Rozmiar pakietu Rozmiar po instalacji Pliki
amd64 1.20+ds-1+b1 475,2 KiB2 294,0 KiB [lista plików]
arm64 1.20+ds-1 438,8 KiB2 249,0 KiB [lista plików]
armel 1.20+ds-1+b1 404,2 KiB2 059,0 KiB [lista plików]
armhf 1.20+ds-1+b1 408,0 KiB1 499,0 KiB [lista plików]
i386 1.20+ds-1+b1 523,4 KiB2 611,0 KiB [lista plików]
mips64el 1.20+ds-1+b1 434,4 KiB2 618,0 KiB [lista plików]
ppc64el 1.20+ds-1+b1 511,2 KiB3 018,0 KiB [lista plików]
riscv64 1.20+ds-1 488,8 KiB1 893,0 KiB [lista plików]
s390x 1.20+ds-1+b1 467,3 KiB2 478,0 KiB [lista plików]