Пакет: ampliconnoise (1.29-13 и другие)

[ Источник: ampliconnoise  ]

removal of noise from 454 sequenced PCR amplicons

AmpliconNoise is a package of applications to clean up high-throughput sequence data. It consists of three main parts:

Pyronoise - does flowgram-based clustering to spot misreads SeqNoise - removes PCR point mutations Perseus - removes PCR chimeras without the need for a set of reference sequences

Previously there was a standalone "Pyronoise" by the same authors and this package includes an updated version. There is also a "Denoiser" in Qiime which is related but distinct.

Теги: Роль: Программа

Другие пакеты, относящиеся к ampliconnoise

• dep: libc6 (>= 2.34) [не alpha, ia64, sh4]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.39) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgsl27 (>= 2.7.1) [ia64]

  GNU Scientific Library (GSL) -- library package

• dep: libgsl28 (>= 2.8+dfsg) [не ia64]

  GNU Scientific Library (GSL) -- library package

• dep: libgslcblas0 (>= 2.8) [sparc64]

  GNU Scientific Library (GSL) -- blas library package

• dep: libopenmpi3t64 (>= 4.1.6)

  high performance message passing library -- shared library

• dep: mafft

  Multiple alignment program for amino acid or nucleotide sequences

• rec: openmpi-bin

  high performance message passing library -- binaries

Загрузка ampliconnoise

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Версия	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
alpha (неофициальный перенос)	1.29-13	1 076,0 Кб	2 525,0 Кб	[список файлов]
amd64	1.29-13	1 083,5 Кб	2 049,0 Кб	[список файлов]
arm64	1.29-13	1 072,2 Кб	2 397,0 Кб	[список файлов]
armel	1.29-13	1 064,8 Кб	1 968,0 Кб	[список файлов]
armhf	1.29-13	1 059,6 Кб	1 832,0 Кб	[список файлов]
hppa (неофициальный перенос)	1.29-13	1 066,0 Кб	1 932,0 Кб	[список файлов]
i386	1.29-13	1 074,4 Кб	2 012,0 Кб	[список файлов]
ia64 (неофициальный перенос)	1.29-11	1 096,8 Кб	2 314,0 Кб	[список файлов]
m68k (неофициальный перенос)	1.29-13	1 053,6 Кб	1 912,0 Кб	[список файлов]
mips64el	1.29-13	1 071,5 Кб	2 419,0 Кб	[список файлов]
ppc64 (неофициальный перенос)	1.29-13	1 085,7 Кб	2 589,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	1.29-13	1 091,4 Кб	2 589,0 Кб	[список файлов]
riscv64	1.29-13	1 078,3 Кб	1 905,0 Кб	[список файлов]
s390x	1.29-13	1 096,4 Кб	2 105,0 Кб	[список файлов]
sh4 (неофициальный перенос)	1.29-13	1 081,3 Кб	2 384,0 Кб	[список файлов]
sparc64 (неофициальный перенос)	1.29-13	1 064,5 Кб	14 888,0 Кб	[список файлов]
x32 (неофициальный перенос)	1.29-13	1 080,3 Кб	2 012,0 Кб	[список файлов]