Пакет: ampliconnoise (1.29-8)

[ Источник: ampliconnoise  ]

removal of noise from 454 sequenced PCR amplicons

AmpliconNoise is a package of applications to clean up high-throughput sequence data. It consists of three main parts:

Pyronoise - does flowgram-based clustering to spot misreads SeqNoise - removes PCR point mutations Perseus - removes PCR chimeras without the need for a set of reference sequences

Previously there was a standalone "Pyronoise" by the same authors and this package includes an updated version. There is also a "Denoiser" in Qiime which is related but distinct.

Теги: Роль: Программа

Другие пакеты, относящиеся к ampliconnoise

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]

  dep: libc6 (>= 2.4) [armhf, i386]

• dep: libgsl23 (>= 2.5)

  GNU Scientific Library (GSL) -- library package

• dep: libgslcblas0 (>= 2.4)

  GNU Scientific Library (GSL) -- blas library package

• dep: libopenmpi3

  high performance message passing library -- shared library

• dep: mafft

  Multiple alignment program for amino acid or nucleotide sequences

• rec: openmpi-bin

  high performance message passing library -- binaries

Загрузка ampliconnoise

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
amd64	464,6 Кб	1 427,0 Кб	[список файлов]
arm64	456,5 Кб	1 365,0 Кб	[список файлов]
armhf	446,3 Кб	1 214,0 Кб	[список файлов]
i386	463,8 Кб	1 402,0 Кб	[список файлов]