Пакет: abyss (2.3.10-1 и другие)

[ Источник: abyss  ]

de novo, parallel, sequence assembler for short reads

ABySS is a de novo, parallel, sequence assembler that is designed for short reads. It may be used to assemble genome or transcriptome sequence data. Parallelization is achieved using MPI, OpenMP and pthread.

Теги: Область: Биология, Реализовано на: C, Пользовательский интерфейс: Командная строка, Роль: Программа

Другие пакеты, относящиеся к abyss

• dep: bsdextrautils [не hppa, sparc64]

  extra utilities from 4.4BSD-Lite

• dep: bsdmainutils [hppa, sparc64]

  Transitional package for more utilities from FreeBSD

• dep: libc6 (>= 2.11) [hppa]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.29) [sparc64]

  dep: libc6 (>= 2.32) [m68k, sh4]

  dep: libc6 (>= 2.34) [x32]

  dep: libc6 (>= 2.38) [amd64, arm64, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64]

• dep: libc6.1 (>= 2.33) [alpha]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.35) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, mips64el, x32]

  вспомогательная библиотека GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64, ppc64el]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64, sh4]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  вспомогательная библиотека GCC

• dep: libgcc1 (>= 1:4.3) [sparc64]

  Пакет недоступен

• dep: libgcc4 (>= 4.1.1) [hppa]

  Пакет недоступен

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  вспомогательная библиотека GCC OpenMP (GOMP)

• dep: libopenmpi3 [sparc64]

  high performance message passing library -- shared library

  dep: libopenmpi3 (>= 4.1.2~rc1) [m68k, sh4]

  dep: libopenmpi3 (>= 4.1.4) [alpha, ia64, x32]

• dep: libopenmpi40 (>= 5.0.6) [amd64, arm64, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64]

  high performance message passing library -- shared library

• dep: libsqlite3-0 (>= 3.5.9)

  динамически подключаемая библиотека SQLite 3

• dep: libstdc++6 (>= 11) [m68k, sh4]

  стандартная библиотека GNU C++ версии 3

  dep: libstdc++6 (>= 12) [alpha, ia64, x32]

  dep: libstdc++6 (>= 14) [amd64, arm64, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64]

  dep: libstdc++6 (>= 5.2) [hppa]

  dep: libstdc++6 (>= 9) [sparc64]

• dep: libunwind8 [ia64]

  библиотека для выявления цепочки вызовов функций в программе

• dep: make

  утилита управления компиляцией

• dep: openmpi-bin [не hppa]

  high performance message passing library -- binaries

• dep: openmpi-common [не hppa]

  high performance message passing library -- common files

• dep: perl

  практический язык Ларри Уолла для извлечения данных и составления отчётов

• sug: openmpi-bin

  high performance message passing library -- binaries

Загрузка abyss

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Версия	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
alpha (неофициальный перенос)	2.3.5+dfsg-2	3 091,4 Кб	12 135,0 Кб	[список файлов]
amd64	2.3.10-1+b1	3 246,5 Кб	10 021,0 Кб	[список файлов]
arm64	2.3.10-1+b1	3 000,6 Кб	10 681,0 Кб	[список файлов]
hppa (неофициальный перенос)	2.1.0-1	2 719,4 Кб	9 671,0 Кб	[список файлов]
ia64 (неофициальный перенос)	2.3.5+dfsg-2	3 493,2 Кб	17 029,0 Кб	[список файлов]
m68k (неофициальный перенос)	2.3.3-2	3 040,2 Кб	9 799,0 Кб	[список файлов]
mips64el	2.3.10-1+b1	3 135,6 Кб	12 561,0 Кб	[список файлов]
ppc64 (неофициальный перенос)	2.3.10-1+b1	3 152,9 Кб	13 053,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	2.3.10-1+b1	3 163,1 Кб	12 409,0 Кб	[список файлов]
riscv64	2.3.10-1+b1	3 185,2 Кб	8 245,0 Кб	[список файлов]
sh4 (неофициальный перенос)	2.3.3-2	3 276,4 Кб	9 167,0 Кб	[список файлов]
sparc64 (неофициальный перенос)	2.2.2-1	2 718,5 Кб	9 131,0 Кб	[список файлов]
x32 (неофициальный перенос)	2.3.5+dfsg-2	3 104,9 Кб	8 946,0 Кб	[список файлов]