Pakiet: abyss (2.3.10-1 i inne)

[ Pakiet źródłowy: abyss  ]

Nowy, równoległy, sekwencyjny asembler do krótkich odczytów

ABySS jest nowym, równoległym asemblerem sekwencji, przeznaczonym do krótkich odczytów. Może być używany do złożenia danych genomu lub transkryptomeksji. Równoległość osiągana jest za pomocą: MPI, OpenMP i pthread.

Znaczniki: Dziedzina: Biologia, Zaimplementowane w: C, Interfejs użytkownika: Wiersz poleceń, Rola: Program

Inne pakiety związane z abyss

• dep: bsdextrautils [nie hppa, sparc64]

  Dodatkowe narzędzia z 4.4BSD-Lite

• dep: bsdmainutils [hppa, sparc64]

  Pakiet przejściowy instalujący więcej narzędzi z FreeBSD

• dep: libc6 (>= 2.11) [hppa]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.29) [sparc64]

  dep: libc6 (>= 2.32) [m68k, sh4]

  dep: libc6 (>= 2.34) [x32]

  dep: libc6 (>= 2.38) [amd64, arm64, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64]

• dep: libc6.1 (>= 2.33) [alpha]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.35) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, mips64el, x32]

  Biblioteka wspomagająca GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64, ppc64el]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64, sh4]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  Biblioteka wspomagająca GCC

• dep: libgcc1 (>= 1:4.3) [sparc64]

  Pakiet niedostępny

• dep: libgcc4 (>= 4.1.1) [hppa]

  Pakiet niedostępny

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  Biblioteka wspierająca GCC OpenMP (GOMP)

• dep: libopenmpi3 [sparc64]

  high performance message passing library -- shared library

  dep: libopenmpi3 (>= 4.1.2~rc1) [m68k, sh4]

  dep: libopenmpi3 (>= 4.1.4) [alpha, ia64, x32]

• dep: libopenmpi40 (>= 5.0.6) [amd64, arm64, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64]

  high performance message passing library -- shared library

• dep: libsqlite3-0 (>= 3.5.9)

  Biblioteka współdzielona SQLite 3

• dep: libstdc++6 (>= 11) [m68k, sh4]

  Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

  dep: libstdc++6 (>= 12) [alpha, ia64, x32]

  dep: libstdc++6 (>= 14) [amd64, arm64, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64]

  dep: libstdc++6 (>= 5.2) [hppa]

  dep: libstdc++6 (>= 9) [sparc64]

• dep: libunwind8 [ia64]

  Biblioteka do ustalania łańcucha wywołań programu - środowisko uruchomieniowe

• dep: make

  Narzędzie do zarządzania procesem kompilacji

• dep: openmpi-bin [nie hppa]

  high performance message passing library -- binaries

• dep: openmpi-common [nie hppa]

  high performance message passing library -- common files

• dep: perl

  praktyczny język ekstrakcji i raportowania Larry'ego Walla

• sug: openmpi-bin

  high performance message passing library -- binaries

Pobieranie abyss

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
alpha (port nieoficjalny)	2.3.5+dfsg-2	3 091,4 KiB	12 135,0 KiB	[lista plików]
amd64	2.3.10-1+b1	3 246,5 KiB	10 021,0 KiB	[lista plików]
arm64	2.3.10-1+b1	3 000,6 KiB	10 681,0 KiB	[lista plików]
hppa (port nieoficjalny)	2.1.0-1	2 719,4 KiB	9 671,0 KiB	[lista plików]
ia64 (port nieoficjalny)	2.3.5+dfsg-2	3 493,2 KiB	17 029,0 KiB	[lista plików]
m68k (port nieoficjalny)	2.3.3-2	3 040,2 KiB	9 799,0 KiB	[lista plików]
mips64el	2.3.10-1+b1	3 135,6 KiB	12 561,0 KiB	[lista plików]
ppc64 (port nieoficjalny)	2.3.10-1+b1	3 152,9 KiB	13 053,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	2.3.10-1+b1	3 163,1 KiB	12 409,0 KiB	[lista plików]
riscv64	2.3.10-1+b1	3 185,2 KiB	8 245,0 KiB	[lista plików]
sh4 (port nieoficjalny)	2.3.3-2	3 276,4 KiB	9 167,0 KiB	[lista plików]
sparc64 (port nieoficjalny)	2.2.2-1	2 718,5 KiB	9 131,0 KiB	[lista plików]
x32 (port nieoficjalny)	2.3.5+dfsg-2	3 104,9 KiB	8 946,0 KiB	[lista plików]