Пакет: abyss (2.2.5+dfsg-1)

[ Источник: abyss  ]

de novo, parallel, sequence assembler for short reads

ABySS is a de novo, parallel, sequence assembler that is designed for short reads. It may be used to assemble genome or transcriptome sequence data. Parallelization is achieved using MPI, OpenMP and pthread.

Теги: Область: Биология, Реализовано на: C, Пользовательский интерфейс: Командная строка, Роль: Программа

Другие пакеты, относящиеся к abyss

• dep: bsdextrautils

  extra utilities from 4.4BSD-Lite

• dep: libc6 (>= 2.29)

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, mips64el, s390x]

  вспомогательная библиотека GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64el]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, mipsel]

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  вспомогательная библиотека GCC OpenMP (GOMP)

• dep: libopenmpi3 (>= 4.0.5)

  high performance message passing library -- shared library

• dep: libsqlite3-0 (>= 3.5.9)

  динамически подключаемая библиотека SQLite 3

• dep: libstdc++6 (>= 5.2) [armel, armhf]

  стандартная библиотека GNU C++ версии 3

  dep: libstdc++6 (>= 9) [не armel, armhf]

• dep: make

  утилита управления компиляцией

• dep: openmpi-bin

  high performance message passing library -- binaries

• dep: openmpi-common

  high performance message passing library -- common files

• dep: perl

  практический язык Ларри Уолла для извлечения данных и составления отчётов

Загрузка abyss

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
amd64	2 939,3 Кб	9 045,0 Кб	[список файлов]
arm64	2 764,0 Кб	8 373,0 Кб	[список файлов]
armel	2 752,4 Кб	8 369,0 Кб	[список файлов]
armhf	2 798,8 Кб	6 741,0 Кб	[список файлов]
i386	3 029,7 Кб	9 589,0 Кб	[список файлов]
mips64el	2 868,5 Кб	10 460,0 Кб	[список файлов]
mipsel	2 897,2 Кб	10 313,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	2 895,8 Кб	11 637,0 Кб	[список файлов]
s390x	2 755,5 Кб	9 053,0 Кб	[список файлов]