Pacote: probalign (1.4-10)

[ Fonte: probalign  ]

multiple sequence alignment using partition function posterior probabilities

Probalign uses partition function posterior probability estimates to compute maximum expected accuracy multiple sequence alignments. It performs statistically significantly better than the leading alignment programs Probcons v1.1, MAFFT v5.851, and MUSCLE v3.6 on BAliBASE 3.0, HOMSTRAD, and OXBENCH benchmarks. Probalign improvements are largest on datasets containing N/C terminal extensions and on datasets with long and heterogeneous length sequences. On heteregeneous length datasets containing repeats Probalign alignment accuracy is 10% and 15% higher than the other three methods when standard deviation of length is at least 300 and 400.

Outros pacotes relacionados a probalign

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
  também um pacote virtual fornecido por libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [não armel, armhf, ppc64el]

  Biblioteca de suporte GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64el]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 11)

  Biblioteca C++ padrão da GNU v3

Download de probalign

Baixe para todas as arquiteturas disponíveis

Arquitetura	Tamanho do pacote	Tamanho instalado	Arquivos
amd64	68.9 kB	175.0 kB	[lista de arquivos]
arm64	64.6 kB	219.0 kB	[lista de arquivos]
armel	55.1 kB	142.0 kB	[lista de arquivos]
armhf	53.9 kB	114.0 kB	[lista de arquivos]
i386	61.4 kB	158.0 kB	[lista de arquivos]
mips64el	65.4 kB	223.0 kB	[lista de arquivos]
mipsel	64.2 kB	221.0 kB	[lista de arquivos]
ppc64el	78.4 kB	219.0 kB	[lista de arquivos]
s390x	56.7 kB	171.0 kB	[lista de arquivos]