Pakiet: murasaki (1.68.6-13 i inne)

[ Pakiet źródłowy: murasaki  ]

homology detection tool across multiple large genomes

Murasaki is a scalable and fast, language theory-based homology detection tool across multiple large genomes. It enable whole-genome scale multiple genome global alignments. Supports unlimited length gapped-seed patterns and unique TF-IDF based filtering.

Murasaki is an anchor alignment software, which is

 * exteremely fast (17 CPU hours for whole Human x Mouse genome (with
   40 nodes: 52 wall minutes))
 * scalable (Arbitrarily parallelizable across multiple nodes using MPI.
   Even a single node with 16GB of ram can handle over 1Gbp of sequence.)
 * unlimited pattern length
 * repeat tolerant
 * intelligent noise reduction

Inne pakiety związane z murasaki

• dep: libboost-filesystem1.83.0 (>= 1.83.0)

  filesystem operations (portable paths, iteration over directories, etc) in C++

• dep: libboost-iostreams1.83.0 (>= 1.83.0)

  Biblioteka Boost.Iostreams

• dep: libc6 (>= 2.34)

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nie armel, armhf, riscv64]

  Biblioteka wspomagająca GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [riscv64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

• dep: murasaki-common

  homology detection tool across multiple large genomes (common files)

Pobieranie murasaki

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	1.68.6-13+b5	611,1 KiB	4 244,0 KiB	[lista plików]
arm64	1.68.6-13+b5	533,9 KiB	4 319,0 KiB	[lista plików]
armel	1.68.6-13+b5	444,2 KiB	3 315,0 KiB	[lista plików]
armhf	1.68.6-13+b5	457,2 KiB	2 339,0 KiB	[lista plików]
i386	1.68.6-13+b5	621,8 KiB	4 071,0 KiB	[lista plików]
mips64el	1.68.6-13+b5	578,5 KiB	5 874,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	1.68.6-13+b4	599,9 KiB	5 536,0 KiB	[lista plików]
riscv64	1.68.6-13+b3	572,8 KiB	3 211,0 KiB	[lista plików]
s390x	1.68.6-13+b4	596,5 KiB	4 799,0 KiB	[lista plików]