パッケージ: murasaki (1.68.6-14 など)

[ ソース: murasaki  ]

homology detection tool across multiple large genomes

Murasaki is a scalable and fast, language theory-based homology detection tool across multiple large genomes. It enable whole-genome scale multiple genome global alignments. Supports unlimited length gapped-seed patterns and unique TF-IDF based filtering.

Murasaki is an anchor alignment software, which is

 * exteremely fast (17 CPU hours for whole Human x Mouse genome (with
   40 nodes: 52 wall minutes))
 * scalable (Arbitrarily parallelizable across multiple nodes using MPI.
   Even a single node with 16GB of ram can handle over 1Gbp of sequence.)
 * unlimited pattern length
 * repeat tolerant
 * intelligent noise reduction

その他の murasaki 関連パッケージ

• dep: libboost-filesystem1.83.0 (>= 1.83.0)

  C++ でのファイルシステム操作 (ポータブルなパス、ディレクトリの列挙など)

• dep: libboost-iostreams1.83.0 (>= 1.83.0)

  Boost.Iostreams ライブラリ

• dep: libc6 (>= 2.38)

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [armel, armhf, riscv64 以外]

  GCC 共有ライブラリ

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [riscv64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 14)

  GNU 標準 C++ ライブラリ v3

• dep: murasaki-common

  homology detection tool across multiple large genomes (common files)

murasaki のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード

アーキテクチャ	バージョン	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
amd64	1.68.6-14+b1	629.6 kB	4,400.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	1.68.6-14+b1	543.3 kB	4,319.0 kB	[ファイル一覧]
armel	1.68.6-14	452.9 kB	3,326.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	1.68.6-14	462.8 kB	2,350.0 kB	[ファイル一覧]
i386	1.68.6-14	638.5 kB	4,166.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	1.68.6-14+b1	596.1 kB	5,866.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	1.68.6-14+b1	606.8 kB	5,600.0 kB	[ファイル一覧]
riscv64	1.68.6-14+b1	584.6 kB	3,203.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	1.68.6-14+b1	606.9 kB	4,827.0 kB	[ファイル一覧]