Package: blixem (4.44.1+dfsg-7.1 and others)

[ Source: seqtools  ]

navigatore interattivo di allineamenti di sequenze

Blixem è un navigatore interattivo di allineamenti di sequenze che sono state impilate in un allineamento multiplo "master-slave"; non è un "vero" allineamento multiplo, ma un allineamento "uno-a-molti".

 * sezione panoramica che mostra le posizioni di geni e allineamenti
   intorno alla finestra di allineamento;
 * sezione dettagliata che mostra l'allineamento effettivo di sequenze
   di proteine o nucleotidi alla sequenza di DNA genomico;
 * visualizzazione di allineamenti rispetto ad entrambi i filamenti della
   sequenza di riferimento;
 * visualizzazione di sequenze in modalità nucleotidi o proteina: in
   modalità proteina, Blixem mostrerà la traduzione a 3 frame della
   sequenza di riferimento;
 * i residui sono evidenziati in colori differenti se sono una
   corrispondenza esatta, una sostituzione conservativa o una mancata
   corrispondenza;
 * sono gestiti allineamenti con gap, con inserzioni e delezioni
   evidenziate nella sequenza corrispondente;
 * le corrispondenze possono essere ordinate e filtrate;
 * SNP e altre variazioni possono essere evidenziate nella sequenza di
   riferimento;
 * le code poli(A) possono essere visualizzate e i segnali poli(A)
   evidenziati nella sequenza di riferimento.

Tags: Interface Toolkit: GTK

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Download blixem

Download for all available architectures

Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
alpha (unofficial port)	4.44.1+dfsg-7.1+b1	1,327.9 kB	2,430.0 kB	[list of files]
amd64	4.44.1+dfsg-7.1+b3	1,348.6 kB	2,220.0 kB	[list of files]
arm64	4.44.1+dfsg-7.1+b3	1,312.6 kB	2,292.0 kB	[list of files]
armel	4.44.1+dfsg-7.1+b3	1,292.3 kB	2,160.0 kB	[list of files]
armhf	4.44.1+dfsg-7.1+b3	1,298.2 kB	1,904.0 kB	[list of files]
hppa (unofficial port)	4.44.1+dfsg-7.1+b2	1,329.3 kB	2,182.0 kB	[list of files]
i386	4.44.1+dfsg-7.1+b3	1,360.9 kB	2,356.0 kB	[list of files]
ia64 (unofficial port)	4.44.1+dfsg-7.1	1,378.9 kB	3,243.0 kB	[list of files]
m68k (unofficial port)	4.44.1+dfsg-7.1+b2	1,336.6 kB	2,246.0 kB	[list of files]
mips64el	4.44.1+dfsg-7.1+b3	1,350.4 kB	2,634.0 kB	[list of files]
ppc64 (unofficial port)	4.44.1+dfsg-7.1+b2	1,346.4 kB	2,676.0 kB	[list of files]
ppc64el	4.44.1+dfsg-7.1+b3	1,348.3 kB	2,548.0 kB	[list of files]
riscv64	4.44.1+dfsg-7.1+b3	1,335.7 kB	2,016.0 kB	[list of files]
s390x	4.44.1+dfsg-7.1+b3	1,322.5 kB	2,270.0 kB	[list of files]
sh4 (unofficial port)	4.44.1+dfsg-7.1+b2	1,359.4 kB	2,228.0 kB	[list of files]
sparc64 (unofficial port)	4.44.1+dfsg-7.1+b2	1,294.2 kB	3,224.0 kB	[list of files]
x32 (unofficial port)	4.44.1+dfsg-7.1+b2	1,347.9 kB	2,164.0 kB	[list of files]