Пакет: blixem (4.44.1+dfsg-7.1 и други)

[ Източник: seqtools  ]

interactive browser of sequence alignments

Blixem is an interactive browser of sequence alignments that have been stacked up in a "master-slave" multiple alignment; it is not a 'true' multiple alignment but a 'one-to-many' alignment.

 * Overview section showing the positions of genes and alignments around
   the alignment window
 * Detail section showing the actual alignment of protein or nucleotide
   sequences to the genomic DNA sequence.
 * View alignments against both strands of the reference sequence.
 * View sequences in nucleotide or protein mode; in protein mode, Blixem
   will display the three-frame translation of the reference sequence.
 * Residues are highlighted in different colours depending on whether
   they are an exact match, conserved substitution or mismatch.
 * Gapped alignments are supported, with insertions and deletions being
   highlighted in the match sequence.
 * Matches can be sorted and filtered.
 * SNPs and other variations can be highlighted in the reference
   sequence.
 * Poly(A) tails can be displayed and poly(A) signals highlighted in the
   reference sequence.

Етикети: Interface Toolkit: GTK

Други пакети, свързани с blixem

• dep: libc6 (>= 2.38) [не alpha, ia64, loong64, sh4]

  GNU C Library: Shared libraries
  също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.40) [loong64, sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

  GNU C Library: Shared libraries
  също и виртуален пакет, предлаган от libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]

• dep: libcairo2 (>= 1.2.4)

  Cairo 2D vector graphics library

• dep: libcurl4 (>= 7.16.2) [ia64]

  easy-to-use client-side URL transfer library (OpenSSL flavour)

• dep: libcurl4t64 (>= 7.16.2) [не ia64]

  easy-to-use client-side URL transfer library (OpenSSL flavour)

• dep: libgbtools0t64 (>= 4.44.1+dfsg)

  library for visualising sequence alignments

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [не armel, armhf, hppa, ia64, m68k]

  GCC support library

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC support library

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC support library

• dep: libglib2.0-0t64 (>= 2.75.3) [ia64]

  GLib library of C routines

  dep: libglib2.0-0t64 (>= 2.76.0) [не ia64]

• dep: libgtk2.0-0t64 (>= 2.14.0)

  GTK graphical user interface library - old version

• dep: libpango-1.0-0 (>= 1.14.0)

  Layout and rendering of internationalized text

• dep: libsqlite3-0 (>= 3.5.9)

  SQLite 3 shared library

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  GNU Standard C++ Library v3

• dep: libunwind8 [ia64]

  library to determine the call-chain of a program - runtime

Изтегляне на blixem

Изтегляне за всички налични архитектури

Архитектура	Версия	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
alpha (неофициална архитектура)	4.44.1+dfsg-7.1+b2	1 327,7 кБ	2 430,0 кБ	[списък на файловете]
amd64	4.44.1+dfsg-7.1+b3	1 348,6 кБ	2 220,0 кБ	[списък на файловете]
arm64	4.44.1+dfsg-7.1+b3	1 312,6 кБ	2 292,0 кБ	[списък на файловете]
armel	4.44.1+dfsg-7.1+b3	1 292,3 кБ	2 160,0 кБ	[списък на файловете]
armhf	4.44.1+dfsg-7.1+b3	1 298,2 кБ	1 904,0 кБ	[списък на файловете]
hppa (неофициална архитектура)	4.44.1+dfsg-7.1+b2	1 329,3 кБ	2 182,0 кБ	[списък на файловете]
i386	4.44.1+dfsg-7.1+b3	1 360,9 кБ	2 356,0 кБ	[списък на файловете]
ia64 (неофициална архитектура)	4.44.1+dfsg-7.1	1 378,9 кБ	3 243,0 кБ	[списък на файловете]
loong64 (неофициална архитектура)	4.44.1+dfsg-7.1+b2	1 325,5 кБ	2 290,0 кБ	[списък на файловете]
m68k (неофициална архитектура)	4.44.1+dfsg-7.1+b2	1 336,6 кБ	2 246,0 кБ	[списък на файловете]
mips64el	4.44.1+dfsg-7.1+b3	1 350,4 кБ	2 634,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64 (неофициална архитектура)	4.44.1+dfsg-7.1+b2	1 346,4 кБ	2 676,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64el	4.44.1+dfsg-7.1+b3	1 348,3 кБ	2 548,0 кБ	[списък на файловете]
riscv64	4.44.1+dfsg-7.1+b3	1 335,7 кБ	2 016,0 кБ	[списък на файловете]
s390x	4.44.1+dfsg-7.1+b3	1 322,5 кБ	2 270,0 кБ	[списък на файловете]
sh4 (неофициална архитектура)	4.44.1+dfsg-7.1+b2	1 359,4 кБ	2 228,0 кБ	[списък на файловете]
sparc64 (неофициална архитектура)	4.44.1+dfsg-7.1+b2	1 294,2 кБ	3 224,0 кБ	[списък на файловете]
x32 (неофициална архитектура)	4.44.1+dfsg-7.1+b2	1 347,9 кБ	2 164,0 кБ	[списък на файловете]