Пакет: blixem (4.44.1+dfsg-7.1 и другие)

[ Источник: seqtools  ]

interactive browser of sequence alignments

Blixem is an interactive browser of sequence alignments that have been stacked up in a "master-slave" multiple alignment; it is not a 'true' multiple alignment but a 'one-to-many' alignment.

 * Overview section showing the positions of genes and alignments around
   the alignment window
 * Detail section showing the actual alignment of protein or nucleotide
   sequences to the genomic DNA sequence.
 * View alignments against both strands of the reference sequence.
 * View sequences in nucleotide or protein mode; in protein mode, Blixem
   will display the three-frame translation of the reference sequence.
 * Residues are highlighted in different colours depending on whether
   they are an exact match, conserved substitution or mismatch.
 * Gapped alignments are supported, with insertions and deletions being
   highlighted in the match sequence.
 * Matches can be sorted and filtered.
 * SNPs and other variations can be highlighted in the reference
   sequence.
 * Poly(A) tails can be displayed and poly(A) signals highlighted in the
   reference sequence.

Теги: Инструментарий интерфейса: GTK

Другие пакеты, относящиеся к blixem

• dep: libatk1.0-0t64 (>= 1.12.4) [sparc64]

  инструментарий специальных возможностей ATK

• dep: libc6 (>= 2.38) [не alpha, ia64, sh4]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]

• dep: libcairo2 (>= 1.2.4)

  библиотека для двухмерной векторной графики Cairo

• dep: libcurl4 (>= 7.16.2) [ia64]

  простая в использовании клиентская библиотека для передачи URL (вариант с OpenSSL)

• dep: libcurl4t64 (>= 7.16.2) [не ia64]

  простая в использовании клиентская библиотека для передачи URL (вариант с OpenSSL)

• dep: libfontconfig1 (>= 2.12.6) [sparc64]

  общая библиотека настроек шрифтов (динамическая версия)

• dep: libfreetype6 (>= 2.2.1) [sparc64]

  движок отрисовки шрифтов FreeType 2 (динамически загружаемые библиотеки)

• dep: libgbtools0t64 (>= 4.44.1+dfsg)

  library for visualising sequence alignments

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [не armel, armhf, hppa, ia64, m68k]

  вспомогательная библиотека GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  вспомогательная библиотека GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  вспомогательная библиотека GCC

• dep: libgdk-pixbuf-2.0-0 (>= 2.22.0) [sparc64]

  библиотека GDK Pixbuf

• dep: libglib2.0-0t64 (>= 2.75.3) [ia64]

  библиотека С-функций

  dep: libglib2.0-0t64 (>= 2.76.0) [не ia64]

• dep: libgtk2.0-0t64 (>= 2.14.0)

  GTK graphical user interface library - old version

• dep: libharfbuzz0b (>= 0.6.0) [sparc64]

  вычисление позиций символов OpenType (библиотека)

• dep: libjsoncpp26 (>= 1.9.6) [sparc64]

  library for reading and writing JSON for C++

• dep: libpango-1.0-0 (>= 1.14.0)

  библиотека компоновки и отрисовки текста на разных языках

• dep: libpangocairo-1.0-0 (>= 1.14.0) [sparc64]

  библиотека компоновки и отрисовки текста на разных языках

• dep: libpangoft2-1.0-0 (>= 1.14.0) [sparc64]

  библиотека компоновки и отрисовки текста на разных языках

• dep: libsqlite3-0 (>= 3.5.9)

  динамически подключаемая библиотека SQLite 3

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  стандартная библиотека GNU C++ версии 3

• dep: libunwind8 [ia64]

  библиотека для выявления цепочки вызовов функций в программе

Загрузка blixem

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Версия	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
alpha (неофициальный перенос)	4.44.1+dfsg-7.1+b1	1 327,9 Кб	2 430,0 Кб	[список файлов]
amd64	4.44.1+dfsg-7.1+b2	1 348,8 Кб	2 220,0 Кб	[список файлов]
arm64	4.44.1+dfsg-7.1+b2	1 313,5 Кб	2 292,0 Кб	[список файлов]
armel	4.44.1+dfsg-7.1+b2	1 292,6 Кб	2 060,0 Кб	[список файлов]
armhf	4.44.1+dfsg-7.1+b2	1 298,8 Кб	1 820,0 Кб	[список файлов]
hppa (неофициальный перенос)	4.44.1+dfsg-7.1+b1	1 328,9 Кб	2 182,0 Кб	[список файлов]
i386	4.44.1+dfsg-7.1+b2	1 360,6 Кб	2 356,0 Кб	[список файлов]
ia64 (неофициальный перенос)	4.44.1+dfsg-7.1	1 378,9 Кб	3 243,0 Кб	[список файлов]
m68k (неофициальный перенос)	4.44.1+dfsg-7.1+b1	1 337,0 Кб	2 246,0 Кб	[список файлов]
mips64el	4.44.1+dfsg-7.1+b2	1 342,6 Кб	2 634,0 Кб	[список файлов]
ppc64 (неофициальный перенос)	4.44.1+dfsg-7.1+b1	1 346,4 Кб	2 676,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	4.44.1+dfsg-7.1+b2	1 347,3 Кб	2 548,0 Кб	[список файлов]
riscv64	4.44.1+dfsg-7.1+b2	1 335,3 Кб	2 016,0 Кб	[список файлов]
s390x	4.44.1+dfsg-7.1+b2	1 322,8 Кб	2 270,0 Кб	[список файлов]
sh4 (неофициальный перенос)	4.44.1+dfsg-7.1+b1	1 359,3 Кб	2 228,0 Кб	[список файлов]
sparc64 (неофициальный перенос)	4.44.1+dfsg-7.1+b1	1 293,7 Кб	3 224,0 Кб	[список файлов]
x32 (неофициальный перенос)	4.44.1+dfsg-7.1+b1	1 348,5 Кб	2 164,0 Кб	[список файлов]