Pakiet: blixem (4.44.1+dfsg-7.1 i inne)

[ Pakiet źródłowy: seqtools  ]

interactive browser of sequence alignments

Blixem is an interactive browser of sequence alignments that have been stacked up in a "master-slave" multiple alignment; it is not a 'true' multiple alignment but a 'one-to-many' alignment.

 * Overview section showing the positions of genes and alignments around
   the alignment window
 * Detail section showing the actual alignment of protein or nucleotide
   sequences to the genomic DNA sequence.
 * View alignments against both strands of the reference sequence.
 * View sequences in nucleotide or protein mode; in protein mode, Blixem
   will display the three-frame translation of the reference sequence.
 * Residues are highlighted in different colours depending on whether
   they are an exact match, conserved substitution or mismatch.
 * Gapped alignments are supported, with insertions and deletions being
   highlighted in the match sequence.
 * Matches can be sorted and filtered.
 * SNPs and other variations can be highlighted in the reference
   sequence.
 * Poly(A) tails can be displayed and poly(A) signals highlighted in the
   reference sequence.

Znaczniki: Pakiet narzędziowy interfejsu: GTK

Inne pakiety związane z blixem

• dep: libatk1.0-0t64 (>= 1.12.4) [sparc64]

  ATK, zestaw narzędzi dostarczający interfejsy dostępu

• dep: libc6 (>= 2.38) [nie alpha, ia64, sh4]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]

• dep: libcairo2 (>= 1.2.4)

  Cairo - biblioteka do dwuwymiarowej grafiki wektorowej

• dep: libcurl4 (>= 7.16.2) [ia64]

  Łatwa w użyciu biblioteka klienta do transferu adresów URL (wersja OpenSSL)

• dep: libcurl4t64 (>= 7.16.2) [nie ia64]

  Łatwa w użyciu biblioteka klienta do transferu adresów URL (wersja OpenSSL)

• dep: libfontconfig1 (>= 2.12.6) [sparc64]

  Ogólna bilioteka konfiuracji czcionek - uruchomieniowa

• dep: libfreetype6 (>= 2.2.1) [sparc64]

  Silnik czcionek FreeType 2, pliki biblioteki współdzielonej

• dep: libgbtools0t64 (>= 4.44.1+dfsg)

  library for visualising sequence alignments

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nie armel, armhf, hppa, ia64, m68k]

  Biblioteka wspomagająca GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  Biblioteka wspomagająca GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  Biblioteka wspomagająca GCC

• dep: libgdk-pixbuf-2.0-0 (>= 2.22.0) [sparc64]

  Biblioteka GDK Pixbuf

• dep: libglib2.0-0t64 (>= 2.75.3) [ia64]

  Glib, biblioteka funkcji języka C

  dep: libglib2.0-0t64 (>= 2.76.0) [nie ia64]

• dep: libgtk2.0-0t64 (>= 2.14.0)

  GTK graphical user interface library - old version

• dep: libharfbuzz0b (>= 0.6.0) [sparc64]

  Mechanizm kształtowania tekstu OpenType (biblioteka współdzielona)

• dep: libjsoncpp26 (>= 1.9.6) [sparc64]

  library for reading and writing JSON for C++

• dep: libpango-1.0-0 (>= 1.14.0)

  Rozmieszeczenie i rendering umiędzynarodowionego tekstu

• dep: libpangocairo-1.0-0 (>= 1.14.0) [sparc64]

  Rozmieszeczenie i rendering umiędzynarodowionego tekstu

• dep: libpangoft2-1.0-0 (>= 1.14.0) [sparc64]

  Rozmieszeczenie i rendering umiędzynarodowionego tekstu

• dep: libsqlite3-0 (>= 3.5.9)

  Biblioteka współdzielona SQLite 3

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

• dep: libunwind8 [ia64]

  Biblioteka do ustalania łańcucha wywołań programu - środowisko uruchomieniowe

Pobieranie blixem

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
alpha (port nieoficjalny)	4.44.1+dfsg-7.1+b1	1 327,9 KiB	2 430,0 KiB	[lista plików]
amd64	4.44.1+dfsg-7.1+b2	1 348,8 KiB	2 220,0 KiB	[lista plików]
arm64	4.44.1+dfsg-7.1+b2	1 313,5 KiB	2 292,0 KiB	[lista plików]
armel	4.44.1+dfsg-7.1+b2	1 292,6 KiB	2 060,0 KiB	[lista plików]
armhf	4.44.1+dfsg-7.1+b2	1 298,8 KiB	1 820,0 KiB	[lista plików]
hppa (port nieoficjalny)	4.44.1+dfsg-7.1+b1	1 328,9 KiB	2 182,0 KiB	[lista plików]
i386	4.44.1+dfsg-7.1+b2	1 360,6 KiB	2 356,0 KiB	[lista plików]
ia64 (port nieoficjalny)	4.44.1+dfsg-7.1	1 378,9 KiB	3 243,0 KiB	[lista plików]
m68k (port nieoficjalny)	4.44.1+dfsg-7.1+b1	1 337,0 KiB	2 246,0 KiB	[lista plików]
mips64el	4.44.1+dfsg-7.1+b2	1 342,6 KiB	2 634,0 KiB	[lista plików]
ppc64 (port nieoficjalny)	4.44.1+dfsg-7.1+b1	1 346,4 KiB	2 676,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	4.44.1+dfsg-7.1+b2	1 347,3 KiB	2 548,0 KiB	[lista plików]
riscv64	4.44.1+dfsg-7.1+b2	1 335,3 KiB	2 016,0 KiB	[lista plików]
s390x	4.44.1+dfsg-7.1+b2	1 322,8 KiB	2 270,0 KiB	[lista plików]
sh4 (port nieoficjalny)	4.44.1+dfsg-7.1+b1	1 359,3 KiB	2 228,0 KiB	[lista plików]
sparc64 (port nieoficjalny)	4.44.1+dfsg-7.1+b1	1 293,7 KiB	3 224,0 KiB	[lista plików]
x32 (port nieoficjalny)	4.44.1+dfsg-7.1+b1	1 348,5 KiB	2 164,0 KiB	[lista plików]