Paketti: blixem (4.44.1+dfsg-7.1 ja muut)

[ Source: seqtools  ]

interactive browser of sequence alignments

Blixem is an interactive browser of sequence alignments that have been stacked up in a "master-slave" multiple alignment; it is not a 'true' multiple alignment but a 'one-to-many' alignment.

 * Overview section showing the positions of genes and alignments around
   the alignment window
 * Detail section showing the actual alignment of protein or nucleotide
   sequences to the genomic DNA sequence.
 * View alignments against both strands of the reference sequence.
 * View sequences in nucleotide or protein mode; in protein mode, Blixem
   will display the three-frame translation of the reference sequence.
 * Residues are highlighted in different colours depending on whether
   they are an exact match, conserved substitution or mismatch.
 * Gapped alignments are supported, with insertions and deletions being
   highlighted in the match sequence.
 * Matches can be sorted and filtered.
 * SNPs and other variations can be highlighted in the reference
   sequence.
 * Poly(A) tails can be displayed and poly(A) signals highlighted in the
   reference sequence.

Tagit: Interface Toolkit: GTK

Muut pakettiin blixem liittyvät paketit

• dep: libc6 (>= 2.38) [ei alpha, ia64, sh4]

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]

• dep: libcairo2 (>= 1.2.4)

  Cairo 2D vector graphics library

• dep: libcurl4 (>= 7.16.2) [ia64]

  easy-to-use client-side URL transfer library (OpenSSL flavour)

• dep: libcurl4t64 (>= 7.16.2) [ei ia64]

  easy-to-use client-side URL transfer library (OpenSSL flavour)

• dep: libgbtools0t64 (>= 4.44.1+dfsg)

  library for visualising sequence alignments

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [ei armel, armhf, hppa, ia64, m68k]

  GCC:n apukirjasto

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC:n apukirjasto

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC:n apukirjasto

• dep: libglib2.0-0t64 (>= 2.75.3) [ia64]

  GLib library of C routines

  dep: libglib2.0-0t64 (>= 2.76.0) [ei ia64]

• dep: libgtk2.0-0t64 (>= 2.14.0)

  GTK graphical user interface library - old version

• dep: libpango-1.0-0 (>= 1.14.0)

  Layout and rendering of internationalized text

• dep: libsqlite3-0 (>= 3.5.9)

  SQLite 3 (jaettu kirjasto)

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  GNU standardi C++ -kirjasto, versio 3

• dep: libunwind8 [ia64]

  library to determine the call-chain of a program - runtime

Imuroi blixem

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille

Arkkitehtuuri	Versio	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
alpha (epävirallinen siirros)	4.44.1+dfsg-7.1+b1	1,327.9 kt	2,430.0 kt	[tiedostoluettelo]
amd64	4.44.1+dfsg-7.1+b3	1,348.6 kt	2,220.0 kt	[tiedostoluettelo]
arm64	4.44.1+dfsg-7.1+b3	1,312.6 kt	2,292.0 kt	[tiedostoluettelo]
armel	4.44.1+dfsg-7.1+b3	1,292.3 kt	2,160.0 kt	[tiedostoluettelo]
armhf	4.44.1+dfsg-7.1+b3	1,298.2 kt	1,904.0 kt	[tiedostoluettelo]
hppa (epävirallinen siirros)	4.44.1+dfsg-7.1+b2	1,329.3 kt	2,182.0 kt	[tiedostoluettelo]
i386	4.44.1+dfsg-7.1+b3	1,360.9 kt	2,356.0 kt	[tiedostoluettelo]
ia64 (epävirallinen siirros)	4.44.1+dfsg-7.1	1,378.9 kt	3,243.0 kt	[tiedostoluettelo]
m68k (epävirallinen siirros)	4.44.1+dfsg-7.1+b2	1,336.6 kt	2,246.0 kt	[tiedostoluettelo]
mips64el	4.44.1+dfsg-7.1+b3	1,350.4 kt	2,634.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64 (epävirallinen siirros)	4.44.1+dfsg-7.1+b2	1,346.4 kt	2,676.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64el	4.44.1+dfsg-7.1+b3	1,348.3 kt	2,548.0 kt	[tiedostoluettelo]
riscv64	4.44.1+dfsg-7.1+b3	1,335.7 kt	2,016.0 kt	[tiedostoluettelo]
s390x	4.44.1+dfsg-7.1+b3	1,322.5 kt	2,270.0 kt	[tiedostoluettelo]
sh4 (epävirallinen siirros)	4.44.1+dfsg-7.1+b2	1,359.4 kt	2,228.0 kt	[tiedostoluettelo]
sparc64 (epävirallinen siirros)	4.44.1+dfsg-7.1+b2	1,294.2 kt	3,224.0 kt	[tiedostoluettelo]
x32 (epävirallinen siirros)	4.44.1+dfsg-7.1+b2	1,347.9 kt	2,164.0 kt	[tiedostoluettelo]