Пакунок: blixem (4.44.1+dfsg-7.1 and others)

[ Source: seqtools  ]

interactive browser of sequence alignments

Blixem is an interactive browser of sequence alignments that have been stacked up in a "master-slave" multiple alignment; it is not a 'true' multiple alignment but a 'one-to-many' alignment.

 * Overview section showing the positions of genes and alignments around
   the alignment window
 * Detail section showing the actual alignment of protein or nucleotide
   sequences to the genomic DNA sequence.
 * View alignments against both strands of the reference sequence.
 * View sequences in nucleotide or protein mode; in protein mode, Blixem
   will display the three-frame translation of the reference sequence.
 * Residues are highlighted in different colours depending on whether
   they are an exact match, conserved substitution or mismatch.
 * Gapped alignments are supported, with insertions and deletions being
   highlighted in the match sequence.
 * Matches can be sorted and filtered.
 * SNPs and other variations can be highlighted in the reference
   sequence.
 * Poly(A) tails can be displayed and poly(A) signals highlighted in the
   reference sequence.

Tags: Interface Toolkit: GTK

Інші пакунки пов'язані з blixem

• dep: libc6 (>= 2.38) [not alpha, ia64, sh4]

  Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

  Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
  also a virtual package provided by libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]

• dep: libcairo2 (>= 1.2.4)

  Cairo 2D — бібліотека векторної графіки

• dep: libcurl4 (>= 7.16.2) [ia64]

  Легка у використанні клієнтська бібліотека передачі URL (різновид OpenSSL)

• dep: libcurl4t64 (>= 7.16.2) [not ia64]

  Легка у використанні клієнтська бібліотека передачі URL (різновид OpenSSL)

• dep: libgbtools0t64 (>= 4.44.1+dfsg)

  library for visualising sequence alignments

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [not armel, armhf, hppa, ia64, m68k]

  Допоміжна бібліотека GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  Допоміжна бібліотека GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  Допоміжна бібліотека GCC

• dep: libglib2.0-0t64 (>= 2.75.3) [ia64]

  Glib бібліотека алгоритмів на Сі

  dep: libglib2.0-0t64 (>= 2.76.0) [not ia64]

• dep: libgtk2.0-0t64 (>= 2.14.0)

  GTK graphical user interface library - old version

• dep: libpango-1.0-0 (>= 1.14.0)

  Форматування та відтворення інтернаціоналізованого тексту

• dep: libsqlite3-0 (>= 3.5.9)

  Колективна бібліотека SQLite 3

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  Стандартна бібліотека C++ GNU, версії 3

• dep: libunwind8 [ia64]

  library to determine the call-chain of a program - runtime

Завантажити blixem

Завантаження для всіх доступних архітектур

Архітектура	Версія	Розмір пакунка	Розмір після встановлення	Файли
alpha (unofficial port)	4.44.1+dfsg-7.1+b1	1,327.9 kB	2,430.0 kB	[список файлів]
amd64	4.44.1+dfsg-7.1+b3	1,348.6 kB	2,220.0 kB	[список файлів]
arm64	4.44.1+dfsg-7.1+b3	1,312.6 kB	2,292.0 kB	[список файлів]
armel	4.44.1+dfsg-7.1+b3	1,292.3 kB	2,160.0 kB	[список файлів]
armhf	4.44.1+dfsg-7.1+b3	1,298.2 kB	1,904.0 kB	[список файлів]
hppa (unofficial port)	4.44.1+dfsg-7.1+b2	1,329.3 kB	2,182.0 kB	[список файлів]
i386	4.44.1+dfsg-7.1+b3	1,360.9 kB	2,356.0 kB	[список файлів]
ia64 (unofficial port)	4.44.1+dfsg-7.1	1,378.9 kB	3,243.0 kB	[список файлів]
m68k (unofficial port)	4.44.1+dfsg-7.1+b2	1,336.6 kB	2,246.0 kB	[список файлів]
mips64el	4.44.1+dfsg-7.1+b3	1,350.4 kB	2,634.0 kB	[список файлів]
ppc64 (unofficial port)	4.44.1+dfsg-7.1+b2	1,346.4 kB	2,676.0 kB	[список файлів]
ppc64el	4.44.1+dfsg-7.1+b3	1,348.3 kB	2,548.0 kB	[список файлів]
riscv64	4.44.1+dfsg-7.1+b3	1,335.7 kB	2,016.0 kB	[список файлів]
s390x	4.44.1+dfsg-7.1+b3	1,322.5 kB	2,270.0 kB	[список файлів]
sh4 (unofficial port)	4.44.1+dfsg-7.1+b2	1,359.4 kB	2,228.0 kB	[список файлів]
sparc64 (unofficial port)	4.44.1+dfsg-7.1+b2	1,294.2 kB	3,224.0 kB	[список файлів]
x32 (unofficial port)	4.44.1+dfsg-7.1+b2	1,347.9 kB	2,164.0 kB	[список файлів]