パッケージ: blixem (4.44.1+dfsg-7.1 など)

blixem に関するリンク

Debian の資源:

seqtools ソースパッケージをダウンロード:

メンテナ:

外部の資源:

ホームページ [www.sanger.ac.uk]

類似のパッケージ:

interactive browser of sequence alignments

Blixem is an interactive browser of sequence alignments that have been stacked up in a "master-slave" multiple alignment; it is not a 'true' multiple alignment but a 'one-to-many' alignment.

 * Overview section showing the positions of genes and alignments around
   the alignment window
 * Detail section showing the actual alignment of protein or nucleotide
   sequences to the genomic DNA sequence.
 * View alignments against both strands of the reference sequence.
 * View sequences in nucleotide or protein mode; in protein mode, Blixem
   will display the three-frame translation of the reference sequence.
 * Residues are highlighted in different colours depending on whether
   they are an exact match, conserved substitution or mismatch.
 * Gapped alignments are supported, with insertions and deletions being
   highlighted in the match sequence.
 * Matches can be sorted and filtered.
 * SNPs and other variations can be highlighted in the reference
   sequence.
 * Poly(A) tails can be displayed and poly(A) signals highlighted in the
   reference sequence.

タグ: インタフェースツールキット: GTK

その他の blixem 関連パッケージ

依存

推奨

提案

enhances

dep: libatk1.0-0t64 (>= 1.12.4) [sparc64]

ATK アクセシビリティツールキット
dep: libc6 (>= 2.38) [alpha, ia64, sh4 以外]

GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]
dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]
dep: libcairo2 (>= 1.2.4)

Cairo 二次元ベクトルグラフィックライブラリ
dep: libcurl4 (>= 7.16.2) [ia64]

使いやすいクライアントサイドの URL 転送ライブラリ (OpenSSL フレーバ)
dep: libcurl4t64 (>= 7.16.2) [ia64 以外]

使いやすいクライアントサイドの URL 転送ライブラリ (OpenSSL フレーバ)
dep: libfontconfig1 (>= 2.12.6) [sparc64]

汎用フォント設定ライブラリ - ランタイム
dep: libfreetype6 (>= 2.2.1) [sparc64]

FreeType 2 フォントエンジン共有ライブラリファイル
dep: libgbtools0t64 (>= 4.44.1+dfsg)

library for visualising sequence alignments
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [armel, armhf, hppa, ia64, m68k 以外]

GCC 共有ライブラリ

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]
dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

GCC 共有ライブラリ
dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

GCC 共有ライブラリ
dep: libgdk-pixbuf-2.0-0 (>= 2.22.0) [sparc64]

GDK Pixbuf ライブラリ
dep: libglib2.0-0t64 (>= 2.75.3) [ia64]

C ルーチンの GLib ライブラリ

dep: libglib2.0-0t64 (>= 2.76.0) [ia64 以外]
dep: libgtk2.0-0t64 (>= 2.14.0)

GTK graphical user interface library - old version
dep: libharfbuzz0b (>= 0.6.0) [sparc64]

OpenType テキスト整形エンジン（共有ライブラリ）
dep: libjsoncpp26 (>= 1.9.6) [sparc64]

library for reading and writing JSON for C++
dep: libpango-1.0-0 (>= 1.14.0)

国際化されたテキストのレイアウトと描画
dep: libpangocairo-1.0-0 (>= 1.14.0) [sparc64]

国際化されたテキストのレイアウトと描画
dep: libpangoft2-1.0-0 (>= 1.14.0) [sparc64]

国際化されたテキストのレイアウトと描画
dep: libsqlite3-0 (>= 3.5.9)

SQLite 3 共有ライブラリ
dep: libstdc++6 (>= 5.2)

GNU 標準 C++ ライブラリ v3
dep: libunwind8 [ia64]

プログラムのコールチェーン測定ライブラリ - ランタイム版

blixem のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード
アーキテクチャ	バージョン	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
alpha (非公式の移植版)	4.44.1+dfsg-7.1+b1	1,327.9 kB	2,430.0 kB	[ファイル一覧]
amd64	4.44.1+dfsg-7.1+b2	1,348.8 kB	2,220.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	4.44.1+dfsg-7.1+b2	1,313.5 kB	2,292.0 kB	[ファイル一覧]
armel	4.44.1+dfsg-7.1+b2	1,292.6 kB	2,060.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	4.44.1+dfsg-7.1+b2	1,298.8 kB	1,820.0 kB	[ファイル一覧]
hppa (非公式の移植版)	4.44.1+dfsg-7.1+b1	1,328.9 kB	2,182.0 kB	[ファイル一覧]
i386	4.44.1+dfsg-7.1+b2	1,360.6 kB	2,356.0 kB	[ファイル一覧]
ia64 (非公式の移植版)	4.44.1+dfsg-7.1	1,378.9 kB	3,243.0 kB	[ファイル一覧]
m68k (非公式の移植版)	4.44.1+dfsg-7.1+b1	1,337.0 kB	2,246.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	4.44.1+dfsg-7.1+b2	1,342.6 kB	2,634.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64 (非公式の移植版)	4.44.1+dfsg-7.1+b1	1,346.4 kB	2,676.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	4.44.1+dfsg-7.1+b2	1,347.3 kB	2,548.0 kB	[ファイル一覧]
riscv64	4.44.1+dfsg-7.1+b2	1,335.3 kB	2,016.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	4.44.1+dfsg-7.1+b2	1,322.8 kB	2,270.0 kB	[ファイル一覧]
sh4 (非公式の移植版)	4.44.1+dfsg-7.1+b1	1,359.3 kB	2,228.0 kB	[ファイル一覧]
sparc64 (非公式の移植版)	4.44.1+dfsg-7.1+b1	1,293.7 kB	3,224.0 kB	[ファイル一覧]
x32 (非公式の移植版)	4.44.1+dfsg-7.1+b1	1,348.5 kB	2,164.0 kB	[ファイル一覧]