Balík: blixem (4.44.1+dfsg-7.1 a iné)

[ Zdroj: seqtools  ]

interactive browser of sequence alignments

Blixem is an interactive browser of sequence alignments that have been stacked up in a "master-slave" multiple alignment; it is not a 'true' multiple alignment but a 'one-to-many' alignment.

 * Overview section showing the positions of genes and alignments around
   the alignment window
 * Detail section showing the actual alignment of protein or nucleotide
   sequences to the genomic DNA sequence.
 * View alignments against both strands of the reference sequence.
 * View sequences in nucleotide or protein mode; in protein mode, Blixem
   will display the three-frame translation of the reference sequence.
 * Residues are highlighted in different colours depending on whether
   they are an exact match, conserved substitution or mismatch.
 * Gapped alignments are supported, with insertions and deletions being
   highlighted in the match sequence.
 * Matches can be sorted and filtered.
 * SNPs and other variations can be highlighted in the reference
   sequence.
 * Poly(A) tails can be displayed and poly(A) signals highlighted in the
   reference sequence.

Značky: Sada nástrojov používateľského rozhrania: GTK

Ostatné balíky súvisiace s balíkom blixem

• dep: libatk1.0-0t64 (>= 1.12.4) [sparc64]

  sada nástrojov prístupnosti ATK

• dep: libc6 (>= 2.38) [nie alpha, ia64, sh4]

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]

• dep: libcairo2 (>= 1.2.4)

  2D vektorová grafická knižnica Cairo

• dep: libcurl4 (>= 7.16.2) [ia64]

  jednoducho použiteľná klientská knižnica na prenos URL (OpenSSL)

• dep: libcurl4t64 (>= 7.16.2) [nie ia64]

  jednoducho použiteľná klientská knižnica na prenos URL (OpenSSL)

• dep: libfontconfig1 (>= 2.12.6) [sparc64]

  všeobecná knižnica na konfiguráciu písiem - dynamické knižnice

• dep: libfreetype6 (>= 2.2.1) [sparc64]

  správa písiem FreeType 2 - zdieľané knižnice

• dep: libgbtools0t64 (>= 4.44.1+dfsg)

  library for visualising sequence alignments

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nie armel, armhf, hppa, ia64, m68k]

  podporná knižnica GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  podporná knižnica GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  podporná knižnica GCC

• dep: libgdk-pixbuf-2.0-0 (>= 2.22.0) [sparc64]

  knižnica GDK Pixbuf

• dep: libglib2.0-0t64 (>= 2.75.3) [ia64]

  knižnica glib funkcií jazyka C

  dep: libglib2.0-0t64 (>= 2.76.0) [nie ia64]

• dep: libgtk2.0-0t64 (>= 2.14.0)

  GTK graphical user interface library - old version

• dep: libharfbuzz0b (>= 0.6.0) [sparc64]

  jadro OpenType na tvarovanie textu - zdieľaná knižnica

• dep: libjsoncpp26 (>= 1.9.6) [sparc64]

  library for reading and writing JSON for C++

• dep: libpango-1.0-0 (>= 1.14.0)

  rozloženie a vykreslenie internacionalizovaného textu

• dep: libpangocairo-1.0-0 (>= 1.14.0) [sparc64]

  rozloženie a vykreslenie internacionalizovaného textu

• dep: libpangoft2-1.0-0 (>= 1.14.0) [sparc64]

  rozloženie a vykreslenie internacionalizovaného textu

• dep: libsqlite3-0 (>= 3.5.9)

  zdieľaná knižnica SQLite 3

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  štandardná knižnica C++ GNU v3

• dep: libunwind8 [ia64]

  nnižnica na určenie na určenie postupnosti volania programu - dynamické súbory

Stiahnuť blixem

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Verzia	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
alpha (neoficiálny port)	4.44.1+dfsg-7.1+b1	1,327.9 kB	2,430.0 kB	[zoznam súborov]
amd64	4.44.1+dfsg-7.1+b2	1,348.8 kB	2,220.0 kB	[zoznam súborov]
arm64	4.44.1+dfsg-7.1+b2	1,313.5 kB	2,292.0 kB	[zoznam súborov]
armel	4.44.1+dfsg-7.1+b2	1,292.6 kB	2,060.0 kB	[zoznam súborov]
armhf	4.44.1+dfsg-7.1+b2	1,298.8 kB	1,820.0 kB	[zoznam súborov]
hppa (neoficiálny port)	4.44.1+dfsg-7.1+b1	1,328.9 kB	2,182.0 kB	[zoznam súborov]
i386	4.44.1+dfsg-7.1+b2	1,360.6 kB	2,356.0 kB	[zoznam súborov]
ia64 (neoficiálny port)	4.44.1+dfsg-7.1	1,378.9 kB	3,243.0 kB	[zoznam súborov]
m68k (neoficiálny port)	4.44.1+dfsg-7.1+b1	1,337.0 kB	2,246.0 kB	[zoznam súborov]
mips64el	4.44.1+dfsg-7.1+b2	1,342.6 kB	2,634.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64 (neoficiálny port)	4.44.1+dfsg-7.1+b1	1,346.4 kB	2,676.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64el	4.44.1+dfsg-7.1+b2	1,347.3 kB	2,548.0 kB	[zoznam súborov]
riscv64	4.44.1+dfsg-7.1+b2	1,335.3 kB	2,016.0 kB	[zoznam súborov]
s390x	4.44.1+dfsg-7.1+b2	1,322.8 kB	2,270.0 kB	[zoznam súborov]
sh4 (neoficiálny port)	4.44.1+dfsg-7.1+b1	1,359.3 kB	2,228.0 kB	[zoznam súborov]
sparc64 (neoficiálny port)	4.44.1+dfsg-7.1+b1	1,293.7 kB	3,224.0 kB	[zoznam súborov]
x32 (neoficiálny port)	4.44.1+dfsg-7.1+b1	1,348.5 kB	2,164.0 kB	[zoznam súborov]