套件：canu（2.2+dfsg-5 以及其他的）

[ 原始碼： canu  ]

single molecule sequence assembler for genomes

Canu is a fork of the Celera Assembler, designed for high-noise single-molecule sequencing (such as the PacBio RS II or Oxford Nanopore MinION).

Canu is a hierarchical assembly pipeline which runs in four steps:

 * Detect overlaps in high-noise sequences using MHAP
 * Generate corrected sequence consensus
 * Trim corrected sequences
 * Assemble trimmed corrected sequences

其他與 canu 有關的套件

• dep: gnuplot [alpha, m68k, sh4]

  Command-line driven interactive plotting program.
  同時作為一個虛擬套件由這些套件填實： gnuplot-nox, gnuplot-qt, gnuplot-x11

• dep: gnuplot-nox [除 alpha, m68k, sh4]

  Command-line driven interactive plotting program. No-X package
  同時作為一個虛擬套件由這些套件填實： gnuplot-qt, gnuplot-x11

  或者 gnuplot

  Command-line driven interactive plotting program.
  同時作為一個虛擬套件由這些套件填實： gnuplot-nox, gnuplot-qt, gnuplot-x11

• dep: libc6 (>= 2.29) [m68k]

  GNU C 函式庫：共用函式庫
  同時作為一個虛擬套件由這些套件填實： libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.32) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.34) [除 alpha, arm64, ia64, m68k, sh4]

  dep: libc6 (>= 2.38) [arm64]

• dep: libc6.1 (>= 2.29) [alpha]

  GNU C 函式庫：共用函式庫
  同時作為一個虛擬套件由這些套件填實： libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libfilesys-df-perl

  Module to obtain filesystem disk space information

• dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha]

  GCC 支援函式庫

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [除 alpha, m68k, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.3) [sparc64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC 支援函式庫

• dep: libgomp1 (>= 6)

  GCC OpenMP (GOMP) support library

• dep: libsnappy1v5 (>= 1.1.10) [除 alpha, arm64, m68k, sh4, sparc64]

  fast compression/decompression library

  dep: libsnappy1v5 (>= 1.1.8) [sparc64]

  dep: libsnappy1v5 (>= 1.2.1) [arm64]

• dep: libstdc++6 (>= 11)

  GNU Standard C++ Library v3

• dep: libunwind8 [ia64]

  library to determine the call-chain of a program - runtime

• dep: mhap

  locality-sensitive hashing to detect long-read overlaps

• dep: perl

  Larry Wall's Practical Extraction and Report Language

• sug: nanopolish

  consensus caller for nanopore sequencing data

• sug: pbgenomicconsensus [alpha, m68k, sh4]

  套件暫時不可用

下載 canu

下載可用於所有硬體架構的

硬體架構	版本	套件大小	安裝後大小	檔案
alpha （非官方移植版）	2.0+dfsg-2	1，228。8 kB	10，538。0 kB	[檔案列表]
amd64	2.2+dfsg-5	1，379。8 kB	13，027。0 kB	[檔案列表]
arm64	2.2+dfsg-5+b1	1，293。4 kB	13，910。0 kB	[檔案列表]
ia64 （非官方移植版）	2.2+dfsg-5	1，553。6 kB	23，779。0 kB	[檔案列表]
m68k （非官方移植版）	2.0+dfsg-2	1，280。7 kB	9，544。0 kB	[檔案列表]
mips64el	2.2+dfsg-5	1，566。0 kB	17，652。0 kB	[檔案列表]
ppc64 （非官方移植版）	2.2+dfsg-5	1，419。2 kB	17，724。0 kB	[檔案列表]
ppc64el	2.2+dfsg-5	1，410。8 kB	16，873。0 kB	[檔案列表]
riscv64	2.2+dfsg-5+b1	1，862。0 kB	15，534。0 kB	[檔案列表]
s390x	2.2+dfsg-5	1，340。9 kB	13，853。0 kB	[檔案列表]
sh4 （非官方移植版）	2.0+dfsg-2	1，230。0 kB	8，637。0 kB	[檔案列表]
sparc64 （非官方移植版）	2.2+dfsg-5	1，507。0 kB	50，253。0 kB	[檔案列表]
x32 （非官方移植版）	2.2+dfsg-5	1，386。5 kB	12，548。0 kB	[檔案列表]