软件包：proteinortho（6.3.1+dfsg-1 以及其他的）

[ 源代码： proteinortho  ]

Detection of (Co-)orthologs in large-scale protein analysis

Proteinortho is a stand-alone tool that is geared towards large datasets and makes use of distributed computing techniques when run on multi-core hardware. It implements an extended version of the reciprocal best alignment heuristic. Proteinortho was applied to compute orthologous proteins in the complete set of all 717 eubacterial genomes available at NCBI at the beginning of 2009. Authors succeeded identifying thirty proteins present in 99% of all bacterial proteomes.

其他与 proteinortho 有关的软件包

• dep: diamond-aligner [alpha, hppa, m68k, sh4, sparc64]

  accelerated BLAST compatible local sequence aligner

  dep: diamond-aligner (>= 2.0.10~) [除 alpha, hppa, m68k, sh4, sparc64]

• dep: libblas3 [sparc64]

  Basic Linear Algebra Reference implementations, shared library

  或者 libblas.so.3

  本虚包由这些包填实： libatlas3-base, libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libc6 (>= 2.32) [m68k, sh4]

  GNU C 语言运行库：共享库
  同时作为一个虚包由这些包填实： libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.34) [除 alpha, hppa, ia64, m68k, sh4, sparc64]

  dep: libc6 (>= 2.7) [hppa, sparc64]

• dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

  GNU C 语言运行库：共享库
  同时作为一个虚包由这些包填实： libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.7) [alpha]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

  GCC 支持库

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC 支持库

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC 支持库

• dep: libgcc1 (>= 1:3.4) [sparc64]

  软件包暂时不可用

• dep: libgomp1 (>= 4.9) [除 alpha, hppa, m68k, sh4, sparc64]

  GCC OpenMP（GOMP）支持库

  dep: libgomp1 (>= 6) [alpha, hppa, m68k, sh4, sparc64]

• dep: liblapack3

  Library of linear algebra routines 3 - shared version

• dep: libstdc++6 (>= 11) [hppa, m68k, sh4]

  GNU 标准 C++ 库，第3版

  dep: libstdc++6 (>= 13.1) [除 alpha, hppa, m68k, sh4, sparc64]

  dep: libstdc++6 (>= 5.2) [alpha, sparc64]

• dep: libunwind8 [ia64]

  library to determine the call-chain of a program - runtime

• dep: ncbi-blast+

  next generation suite of BLAST sequence search tools

• dep: perl [除 sparc64]

  拉里 沃尔的实用报表提取语言(Perl)

• dep: procps [除 sparc64]

  /proc 文件系统工具

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

下载 proteinortho

下载可用于所有硬件架构的

硬件架构	版本	软件包大小	安装后大小	文件
alpha （非官方移植版）	6.0.31+dfsg-1	210.9 kB	832.0 kB	[文件列表]
amd64	6.3.1+dfsg-1	341.5 kB	1,177.0 kB	[文件列表]
arm64	6.3.1+dfsg-1	312.1 kB	1,181.0 kB	[文件列表]
hppa （非官方移植版）	6.0.31+dfsg-2	207.9 kB	780.0 kB	[文件列表]
ia64 （非官方移植版）	6.3.1+dfsg-1	397.3 kB	1,577.0 kB	[文件列表]
m68k （非官方移植版）	6.0.31+dfsg-2	207.1 kB	771.0 kB	[文件列表]
ppc64 （非官方移植版）	6.3.1+dfsg-1	337.2 kB	1,245.0 kB	[文件列表]
ppc64el	6.3.1+dfsg-1	334.7 kB	1,245.0 kB	[文件列表]
riscv64	6.3.1+dfsg-1	341.6 kB	1,033.0 kB	[文件列表]
s390x	6.3.1+dfsg-1	310.6 kB	1,125.0 kB	[文件列表]
sh4 （非官方移植版）	6.0.31+dfsg-2	221.7 kB	764.0 kB	[文件列表]
sparc64 （非官方移植版）	6.0.8+dfsg-1	187.0 kB	834.0 kB	[文件列表]
x32 （非官方移植版）	6.3.1+dfsg-1	346.8 kB	1,162.0 kB	[文件列表]