Пакунок: ggd-utils (1.0.0+ds-1 and others)

[ Source: ggd-utils  ]

programs for use in ggd

Takes a genome file and (currently) a .vcf.gz or a .bed.gz and checks that:

    * a .tbi is present
    * the VCF has ""##fileformat=VCF" as the first
    line
    * the VCF has a #CHROM header
    * the chromosome are in the order specified by
    the genome file (and present)
    * the positions are sorted
    * the positions are <= the chromosome lengths
    defined in the genome file.

As a result, any new genome going into GGD will have a .genome file that will dictate the sort order and presence or absence of the 'chr' prefix for chromosomes

Інші пакунки пов'язані з ggd-utils

• dep: libc6 (>= 2.34)

  Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
  also a virtual package provided by libc6-udeb

Завантажити ggd-utils

Завантаження для всіх доступних архітектур

Архітектура	Версія	Розмір пакунка	Розмір після встановлення	Файли
amd64	1.0.0+ds-1+b12	2,113.8 kB	6,191.0 kB	[список файлів]
arm64	1.0.0+ds-1+b12	1,826.3 kB	5,884.0 kB	[список файлів]
armel	1.0.0+ds-1+b12	1,798.6 kB	6,035.0 kB	[список файлів]
armhf	1.0.0+ds-1+b12	1,792.8 kB	6,035.0 kB	[список файлів]
i386	1.0.0+ds-1+b12	1,953.0 kB	5,991.0 kB	[список файлів]
mips64el	1.0.0+ds-1+b12	1,635.5 kB	6,734.0 kB	[список файлів]
ppc64el	1.0.0+ds-1+b12	1,813.2 kB	6,074.0 kB	[список файлів]
riscv64	1.0.0+ds-1+b7	1,791.5 kB	5,819.0 kB	[список файлів]
s390x	1.0.0+ds-1+b12	1,922.3 kB	6,523.0 kB	[список файлів]