Package: ggd-utils (1.0.0+ds-1 and others)

[ Source: ggd-utils  ]

programmi per l'uso in ggd

Accetta un file di genoma e (attualmente) un .vcf.gz o un .bed.gz e verifica che:

    * sia presente un .tbi;
    * il VCF abbia ""##fileformat=VCF" come prima riga;
    * il VCF abbia un'intestazione #CHROM;
    * i cromosomi siano nell'ordine specificato dal file del genoma (e
      presenti);
    * le posizioni siano ordinate;
    * le posizioni siano <= delle lunghezze dei cromosomi definiti nel file
      del genoma.

Come risultato, ogni nuovo genoma passato a GGD ha un file .genome che detta l'ordine di ordinamento e la presenza o assenza del prefisso "chr" per i cromosomi.

Other Packages Related to ggd-utils

• dep: libc6 (>= 2.34)

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6-udeb

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Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
amd64	1.0.0+ds-1+b16	2,206.1 kB	6,605.0 kB	[list of files]
arm64	1.0.0+ds-1+b16	1,895.3 kB	6,162.0 kB	[list of files]
armel	1.0.0+ds-1+b16	1,964.1 kB	6,504.0 kB	[list of files]
armhf	1.0.0+ds-1+b16	1,958.5 kB	6,504.0 kB	[list of files]
i386	1.0.0+ds-1+b16	2,127.9 kB	6,428.0 kB	[list of files]
mips64el	1.0.0+ds-1+b16	1,791.9 kB	7,204.0 kB	[list of files]
ppc64el	1.0.0+ds-1+b16	1,888.7 kB	6,417.0 kB	[list of files]
riscv64	1.0.0+ds-1+b11	1,962.8 kB	6,225.0 kB	[list of files]
s390x	1.0.0+ds-1+b16	2,005.8 kB	6,865.0 kB	[list of files]