[ Källkod: canu ]
Paket: canu (2.0+dfsg-1)
Länkar för canu
Debianresurser:
Hämta källkodspaketet canu:
Ansvarig:
Externa resurser:
- Hemsida [canu.readthedocs.org]
Liknande paket:
single molecule sequence assembler for genomes
Canu is a fork of the Celera Assembler, designed for high-noise single-molecule sequencing (such as the PacBio RS II or Oxford Nanopore MinION).
Canu is a hierarchical assembly pipeline which runs in four steps:
* Detect overlaps in high-noise sequences using MHAP * Generate corrected sequence consensus * Trim corrected sequences * Assemble trimmed corrected sequences
Andra paket besläktade med canu
|
|
|
|
-
- dep: gnuplot
- Command-line driven interactive plotting program.
också ett virtuellt paket som tillhandahålls av gnuplot-nox, gnuplot-qt, gnuplot-x11
-
- dep: libc6 (>= 2.29)
- GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb
-
- dep: libfilesys-df-perl
- Module to obtain filesystem disk space information
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [ej armel, armhf, i386, mipsel]
- GCC stödbibliotek
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, mipsel]
-
- dep: libgomp1 (>= 6)
- GCC OpenMP (GOMP) support library
-
- dep: libstdc++6 (>= 5.2)
- GNU standardbibliotek v3 för C++
-
- dep: mhap (>= 2.1.3)
- locality-sensitive hashing to detect long-read overlaps
-
- dep: perl
- Larry Wall's Practical Extraction and Report Language
-
- sug: nanopolish
- consensus caller for nanopore sequencing data
-
- sug: pbgenomicconsensus
- Paketet inte tillgängligt
Hämta canu
Arkitektur | Paketstorlek | Installerad storlek | Filer |
---|---|---|---|
amd64 | 1.226,6 kbyte | 9.210,0 kbyte | [filförteckning] |
arm64 | 1.100,2 kbyte | 8.667,0 kbyte | [filförteckning] |
armel | 1.075,7 kbyte | 8.521,0 kbyte | [filförteckning] |
armhf | 1.101,1 kbyte | 6.673,0 kbyte | [filförteckning] |
i386 | 1.352,2 kbyte | 10.418,0 kbyte | [filförteckning] |
mips64el | 1.342,8 kbyte | 12.314,0 kbyte | [filförteckning] |
mipsel | 1.386,0 kbyte | 11.249,0 kbyte | [filförteckning] |
ppc64el | 1.218,4 kbyte | 12.366,0 kbyte | [filförteckning] |
s390x | 1.072,7 kbyte | 9.029,0 kbyte | [filförteckning] |