[ Source: canu ]
Paketti: canu (2.0+dfsg-1)
Links for canu
Debian-palvelut:
Imuroi lähdekoodipaketti canu:
Ylläpitäjä:
External Resources:
- Kotisivu [canu.readthedocs.org]
Samankaltaisia paketteja:
single molecule sequence assembler for genomes
Canu is a fork of the Celera Assembler, designed for high-noise single-molecule sequencing (such as the PacBio RS II or Oxford Nanopore MinION).
Canu is a hierarchical assembly pipeline which runs in four steps:
* Detect overlaps in high-noise sequences using MHAP * Generate corrected sequence consensus * Trim corrected sequences * Assemble trimmed corrected sequences
Muut pakettiin canu liittyvät paketit
|
|
|
|
-
- dep: gnuplot
- Command-line driven interactive plotting program.
myös näennäispaketti, jonka toteuttaa gnuplot-nox, gnuplot-qt, gnuplot-x11
-
- dep: libc6 (>= 2.29)
- GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb
-
- dep: libfilesys-df-perl
- Module to obtain filesystem disk space information
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [ei armel, armhf, i386, mipsel]
- GCC:n apukirjasto
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, mipsel]
-
- dep: libgomp1 (>= 6)
- GCC OpenMP (GOMP) support library
-
- dep: libstdc++6 (>= 5.2)
- GNU standardi C++ -kirjasto, versio 3
-
- dep: mhap (>= 2.1.3)
- locality-sensitive hashing to detect long-read overlaps
-
- dep: perl
- Larry Wallin kieli tekstitiedostojen analysointia ja raportointia varten
-
- sug: nanopolish
- consensus caller for nanopore sequencing data
-
- sug: pbgenomicconsensus
- Paketti ei saatavilla
Imuroi canu
Arkkitehtuuri | Paketin koko | Koko asennettuna | Tiedostot |
---|---|---|---|
amd64 | 1,226.6 kt | 9,210.0 kt | [tiedostoluettelo] |
arm64 | 1,100.2 kt | 8,667.0 kt | [tiedostoluettelo] |
armel | 1,075.7 kt | 8,521.0 kt | [tiedostoluettelo] |
armhf | 1,101.1 kt | 6,673.0 kt | [tiedostoluettelo] |
i386 | 1,352.2 kt | 10,418.0 kt | [tiedostoluettelo] |
mips64el | 1,342.8 kt | 12,314.0 kt | [tiedostoluettelo] |
mipsel | 1,386.0 kt | 11,249.0 kt | [tiedostoluettelo] |
ppc64el | 1,218.4 kt | 12,366.0 kt | [tiedostoluettelo] |
s390x | 1,072.7 kt | 9,029.0 kt | [tiedostoluettelo] |