[ Quellcode: canu ]
Paket: canu (2.0+dfsg-1)
Links für canu
Debian-Ressourcen:
Quellcode-Paket canu herunterladen:
Betreuer:
Externe Ressourcen:
- Homepage [canu.readthedocs.org]
Ähnliche Pakete:
single molecule sequence assembler for genomes
Canu is a fork of the Celera Assembler, designed for high-noise single-molecule sequencing (such as the PacBio RS II or Oxford Nanopore MinION).
Canu is a hierarchical assembly pipeline which runs in four steps:
* Detect overlaps in high-noise sequences using MHAP * Generate corrected sequence consensus * Trim corrected sequences * Assemble trimmed corrected sequences
Andere Pakete mit Bezug zu canu
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- dep: gnuplot
- Kommandozeilengesteuertes, interaktives Plot-Programm
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch gnuplot-nox, gnuplot-qt, gnuplot-x11
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- dep: libc6 (>= 2.29)
- GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb
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- dep: libfilesys-df-perl
- Modul zur Gewinnung von Informationen zur Plattennutzung von Dateisystemen
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- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nicht armel, armhf, i386, mipsel]
- GCC Support-Bibliothek
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, mipsel]
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- dep: libgomp1 (>= 6)
- Unterstützungsbibliothek für GCC OpenMP (GOMP)
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- dep: libstdc++6 (>= 5.2)
- GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)
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- dep: mhap (>= 2.1.3)
- locality-sensitive hashing to detect long-read overlaps
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- dep: perl
- Larry Wall's Practical Extraction und Report Language
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- sug: nanopolish
- consensus caller for nanopore sequencing data
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- sug: pbgenomicconsensus
- Paket nicht verfügbar
canu herunterladen
Architektur | Paketgröße | Größe (installiert) | Dateien |
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amd64 | 1.226,6 kB | 9.210,0 kB | [Liste der Dateien] |
arm64 | 1.100,2 kB | 8.667,0 kB | [Liste der Dateien] |
armel | 1.075,7 kB | 8.521,0 kB | [Liste der Dateien] |
armhf | 1.101,1 kB | 6.673,0 kB | [Liste der Dateien] |
i386 | 1.352,2 kB | 10.418,0 kB | [Liste der Dateien] |
mips64el | 1.342,8 kB | 12.314,0 kB | [Liste der Dateien] |
mipsel | 1.386,0 kB | 11.249,0 kB | [Liste der Dateien] |
ppc64el | 1.218,4 kB | 12.366,0 kB | [Liste der Dateien] |
s390x | 1.072,7 kB | 9.029,0 kB | [Liste der Dateien] |