Пакет: python3-cyvcf2 (0.31.0-1)

[ Источник: cyvcf2  ]

VCF parser based on htslib (Python 3)

This modules allows fast parsing of VCF and BCF including region-queries with Python. This is essential for efficient analyses of nucleotide variation with Python on high-throughput sequencing data.

cyvcf2 is a cython wrapper around htslib. Attributes like variant.gt_ref_depths return a numpy array directly so they are immediately ready for downstream use.

This package installs the library for Python 3.

Другие пакеты, относящиеся к python3-cyvcf2

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.7) [не amd64, arm64, ppc64el, riscv64]

• dep: libhts3t64 (>= 1.17)

  C library for high-throughput sequencing data formats

• dep: python3

  интерактивный высокоуровневый объектно-ориентированный язык (версия python3 по умолчанию)

  dep: python3 (<< 3.13)

  dep: python3 (>= 3.11~)

• dep: python3-click

  Wrapper around optparse for command line utilities - Python 3.x

• dep: python3-coloredlogs

  colored terminal output for Python 3's logging module

• dep: python3-numpy (>= 1:1.25.0)

  Fast array facility to the Python language (Python 3)

• dep: python3-numpy-abi9

  виртуальный пакет, предоставляемый python3-numpy

Загрузка python3-cyvcf2

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
amd64	983,1 Кб	5 498,0 Кб	[список файлов]
arm64	923,9 Кб	5 460,0 Кб	[список файлов]
armel	923,5 Кб	5 332,0 Кб	[список файлов]
armhf	933,7 Кб	4 980,0 Кб	[список файлов]
i386	985,0 Кб	5 558,0 Кб	[список файлов]
mips64el	883,1 Кб	5 556,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	962,7 Кб	5 780,0 Кб	[список файлов]
riscv64	977,5 Кб	5 192,0 Кб	[список файлов]
s390x	946,9 Кб	5 500,0 Кб	[список файлов]