Пакет: python3-cyvcf2 (0.31.1-2)

[ Източник: cyvcf2  ]

VCF parser based on htslib (Python 3)

This modules allows fast parsing of VCF and BCF including region-queries with Python. This is essential for efficient analyses of nucleotide variation with Python on high-throughput sequencing data.

cyvcf2 is a cython wrapper around htslib. Attributes like variant.gt_ref_depths return a numpy array directly so they are immediately ready for downstream use.

This package installs the library for Python 3.

Други пакети, свързани с python3-cyvcf2

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  GNU C Library: Shared libraries
  също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.7) [не amd64, arm64, ppc64el, riscv64]

• dep: libhts3t64 (>= 1.17)

  C library for high-throughput sequencing data formats

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

  dep: python3 (<< 3.13)

  dep: python3 (>= 3.12~)

• dep: python3-click

  Command-Line Interface Creation Kit - Python 3.x

• dep: python3-coloredlogs

  colored terminal output for Python 3's logging module

• dep: python3-numpy (>= 1:1.25.0)

  Fast array facility to the Python language (Python 3)

• dep: python3-numpy-abi9

  виртуален пакет, предлаган от python3-numpy

Изтегляне на python3-cyvcf2

Изтегляне за всички налични архитектури

Архитектура	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
amd64	877,9 кБ	5 581,0 кБ	[списък на файловете]
arm64	840,7 кБ	5 472,0 кБ	[списък на файловете]
armel	843,4 кБ	5 482,0 кБ	[списък на файловете]
armhf	846,9 кБ	5 278,0 кБ	[списък на файловете]
i386	880,5 кБ	5 627,0 кБ	[списък на файловете]
mips64el	819,9 кБ	5 554,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64el	869,0 кБ	5 664,0 кБ	[списък на файловете]
riscv64	874,1 кБ	5 360,0 кБ	[списък на файловете]
s390x	858,2 кБ	5 556,0 кБ	[списък на файловете]