Paket: python3-cyvcf2 (0.31.1-2 och andra)

[ Källkod: cyvcf2  ]

VCF parser based on htslib (Python 3)

This modules allows fast parsing of VCF and BCF including region-queries with Python. This is essential for efficient analyses of nucleotide variation with Python on high-throughput sequencing data.

cyvcf2 is a cython wrapper around htslib. Attributes like variant.gt_ref_depths return a numpy array directly so they are immediately ready for downstream use.

This package installs the library for Python 3.

Andra paket besläktade med python3-cyvcf2

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
  också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.7) [ej amd64, arm64, ppc64el, riscv64]

• dep: libhts3t64 (>= 1.17)

  C library for high-throughput sequencing data formats

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

  dep: python3 (<< 3.14)

  dep: python3 (>= 3.13~)

• dep: python3-click

  Command-Line Interface Creation Kit - Python 3.x

• dep: python3-coloredlogs

  colored terminal output for Python 3's logging module

• dep: python3-numpy

  Python library for numerical computations (Python 3)

• dep: python3-numpy2-abi0

  virtuellt paket som tillhandahålls av python3-numpy

  eller python3-numpy-abi9

  Paketet inte tillgängligt

Hämta python3-cyvcf2

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer

Arkitektur	Version	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
amd64	0.31.1-2+b3	886,6 kbyte	5.624,0 kbyte	[filförteckning]
arm64	0.31.1-2+b3	849,1 kbyte	5.559,0 kbyte	[filförteckning]
armel	0.31.1-2+b3	848,3 kbyte	5.549,0 kbyte	[filförteckning]
armhf	0.31.1-2+b3	852,8 kbyte	5.357,0 kbyte	[filförteckning]
i386	0.31.1-2+b4	881,9 kbyte	5.645,0 kbyte	[filförteckning]
mips64el	0.31.1-2+b3	825,7 kbyte	5.642,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64el	0.31.1-2+b3	874,6 kbyte	5.751,0 kbyte	[filförteckning]
riscv64	0.31.1-2+b3	883,3 kbyte	5.403,0 kbyte	[filförteckning]
s390x	0.31.1-2+b3	864,6 kbyte	5.594,0 kbyte	[filförteckning]