Pakiet: python3-cyvcf2 (0.31.0-1)

[ Pakiet źródłowy: cyvcf2  ]

VCF parser based on htslib (Python 3)

This modules allows fast parsing of VCF and BCF including region-queries with Python. This is essential for efficient analyses of nucleotide variation with Python on high-throughput sequencing data.

cyvcf2 is a cython wrapper around htslib. Attributes like variant.gt_ref_depths return a numpy array directly so they are immediately ready for downstream use.

This package installs the library for Python 3.

Inne pakiety związane z python3-cyvcf2

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.7) [nie amd64, arm64, ppc64el, riscv64]

• dep: libhts3t64 (>= 1.17)

  C library for high-throughput sequencing data formats

• dep: python3

  Interaktywny, wysokopoziomowy i obiektowy język programowania (domyślna wersja Python 3)

  dep: python3 (<< 3.13)

  dep: python3 (>= 3.11~)

• dep: python3-click

  Wrapper around optparse for command line utilities - Python 3.x

• dep: python3-coloredlogs

  colored terminal output for Python 3's logging module

• dep: python3-numpy (>= 1:1.25.0)

  Fast array facility to the Python language (Python 3)

• dep: python3-numpy-abi9

  pakiet wirtualny udostępniany przez python3-numpy

Pobieranie python3-cyvcf2

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	983,1 KiB	5 498,0 KiB	[lista plików]
arm64	923,9 KiB	5 460,0 KiB	[lista plików]
armel	923,5 KiB	5 332,0 KiB	[lista plików]
armhf	933,7 KiB	4 980,0 KiB	[lista plików]
i386	985,0 KiB	5 558,0 KiB	[lista plików]
mips64el	883,1 KiB	5 556,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	962,7 KiB	5 780,0 KiB	[lista plików]
riscv64	977,5 KiB	5 192,0 KiB	[lista plików]
s390x	946,9 KiB	5 500,0 KiB	[lista plików]