Pakiet: python3-cyvcf2 (0.31.1-2 i inne)

[ Pakiet źródłowy: cyvcf2  ]

VCF parser based on htslib (Python 3)

This modules allows fast parsing of VCF and BCF including region-queries with Python. This is essential for efficient analyses of nucleotide variation with Python on high-throughput sequencing data.

cyvcf2 is a cython wrapper around htslib. Attributes like variant.gt_ref_depths return a numpy array directly so they are immediately ready for downstream use.

This package installs the library for Python 3.

Inne pakiety związane z python3-cyvcf2

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.7) [nie amd64, arm64, ppc64el, riscv64]

• dep: libhts3t64 (>= 1.17)

  C library for high-throughput sequencing data formats

• dep: python3

  Interaktywny, wysokopoziomowy i obiektowy język programowania (domyślna wersja Python 3)

  dep: python3 (<< 3.14)

  dep: python3 (>= 3.13~)

• dep: python3-click

  Command-Line Interface Creation Kit - Python 3.x

• dep: python3-coloredlogs

  colored terminal output for Python 3's logging module

• dep: python3-numpy

  Biblioteka Pythona do obliczeń numerycznych (Python 3)

• dep: python3-numpy2-abi0

  pakiet wirtualny udostępniany przez python3-numpy

  lub python3-numpy-abi9

  Pakiet niedostępny

Pobieranie python3-cyvcf2

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	0.31.1-2+b3	886,6 KiB	5 624,0 KiB	[lista plików]
arm64	0.31.1-2+b3	849,1 KiB	5 559,0 KiB	[lista plików]
armel	0.31.1-2+b3	848,3 KiB	5 549,0 KiB	[lista plików]
armhf	0.31.1-2+b3	852,8 KiB	5 357,0 KiB	[lista plików]
i386	0.31.1-2+b4	881,9 KiB	5 645,0 KiB	[lista plików]
mips64el	0.31.1-2+b3	825,7 KiB	5 642,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	0.31.1-2+b3	874,6 KiB	5 751,0 KiB	[lista plików]
riscv64	0.31.1-2+b3	883,3 KiB	5 403,0 KiB	[lista plików]
s390x	0.31.1-2+b3	864,6 KiB	5 594,0 KiB	[lista plików]