Package: python3-cyvcf2 (0.31.1-2 and others)

[ Source: cyvcf2  ]

VCF-fortolker baseret på htslib - Python 3

Dette modul tillader hurtig fortolkning af VCF og BCF inklusive regionsforespørgsler med Python. Dette er essentielt for effektiv analyse af nukleotid variation med Python på sekventeringsdata med høj-gennemløb.

Cyvcf2 er et cython-omslag omkring htslib. Attributter som variant.gt_ref_depths returnerer en numpy-tabel direkte, så de er direkte klar til brug.

Denne pakke installerer biblioteket for Python 3.

Other Packages Related to python3-cyvcf2

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.7) [not amd64, arm64, ppc64el, riscv64]

• dep: libhts3t64 (>= 1.17)

  C-bibliotek for høj-gennemløb sekvensdataformater

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

  dep: python3 (<< 3.14)

  dep: python3 (>= 3.12~)

• dep: python3-click

  Oprettelsessæt for kommandolinjegrænsefladen - Python 3.x

• dep: python3-coloredlogs

  Farvelagt terminal for Python 3's logningsmodul

• dep: python3-numpy (>= 1:1.25.0)

  Hurtig tabelfacilitet til Python 3-sproget

• dep: python3-numpy-abi9

  virtual package provided by python3-numpy

Download python3-cyvcf2

Download for all available architectures

Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
amd64	0.31.1-2+b1	1,003.2 kB	6,414.0 kB	[list of files]
arm64	0.31.1-2+b1	932.5 kB	6,198.0 kB	[list of files]
armel	0.31.1-2+b1	945.0 kB	6,216.0 kB	[list of files]
armhf	0.31.1-2+b1	951.4 kB	5,804.0 kB	[list of files]
i386	0.31.1-2+b2	993.2 kB	6,506.0 kB	[list of files]
mips64el	0.31.1-2+b1	893.3 kB	6,360.0 kB	[list of files]
ppc64el	0.31.1-2+b1	962.0 kB	6,582.0 kB	[list of files]
riscv64	0.31.1-2+b1	986.7 kB	5,968.0 kB	[list of files]
s390x	0.31.1-2+b1	964.9 kB	6,356.0 kB	[list of files]