Пакет: python3-cyvcf2 (0.30.18-1 и другие)

[ Источник: cyvcf2  ]

VCF parser based on htslib (Python 3)

This modules allows fast parsing of VCF and BCF including region-queries with Python. This is essential for efficient analyses of nucleotide variation with Python on high-throughput sequencing data.

cyvcf2 is a cython wrapper around htslib. Attributes like variant.gt_ref_depths return a numpy array directly so they are immediately ready for downstream use.

This package installs the library for Python 3.

Другие пакеты, относящиеся к python3-cyvcf2

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.7) [не amd64, arm64, ppc64el]

• dep: libhts3 (>= 1.10)

  C library for high-throughput sequencing data formats

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

  dep: python3 (<< 3.12)

  dep: python3 (>= 3.11~)

• dep: python3-click

  Wrapper around optparse for command line utilities - Python 3.x

• dep: python3-coloredlogs

  colored terminal output for Python 3's logging module

• dep: python3-numpy (>= 1:1.22.0)

  Fast array facility to the Python 3 language

• dep: python3-numpy-abi9

  виртуальный пакет, предоставляемый python3-numpy

Загрузка python3-cyvcf2

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Версия	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
amd64	0.30.18-1+b2	783,8 Кб	4 710,0 Кб	[список файлов]
arm64	0.30.18-1+b2	755,0 Кб	4 725,0 Кб	[список файлов]
armel	0.30.18-1+b2	753,1 Кб	4 624,0 Кб	[список файлов]
armhf	0.30.18-1+b2	754,1 Кб	4 452,0 Кб	[список файлов]
i386	0.30.18-1+b2	782,4 Кб	4 726,0 Кб	[список файлов]
mips64el	0.30.18-1+b2	735,7 Кб	4 740,0 Кб	[список файлов]
mipsel	0.30.18-1+b2	735,5 Кб	4 719,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	0.30.18-1+b2	778,0 Кб	4 853,0 Кб	[список файлов]
s390x	0.30.18-1+b2	745,3 Кб	4 708,0 Кб	[список файлов]