Пакет: python3-cyvcf2 (0.31.1-2 и другие)

[ Источник: cyvcf2  ]

VCF parser based on htslib (Python 3)

This modules allows fast parsing of VCF and BCF including region-queries with Python. This is essential for efficient analyses of nucleotide variation with Python on high-throughput sequencing data.

cyvcf2 is a cython wrapper around htslib. Attributes like variant.gt_ref_depths return a numpy array directly so they are immediately ready for downstream use.

This package installs the library for Python 3.

Другие пакеты, относящиеся к python3-cyvcf2

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.7) [не alpha, amd64, arm64, ia64, ppc64el, riscv64, sh4, x32]

• dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.7) [alpha]

• dep: libhts3t64 (>= 1.17)

  C library for high-throughput sequencing data formats

• dep: python3

  интерактивный высокоуровневый объектно-ориентированный язык (версия python3 по умолчанию)

  dep: python3 (<< 3.13) [ia64, x32]

  dep: python3 (<< 3.14) [не ia64, x32]

  dep: python3 (>= 3.11~) [ia64]

  dep: python3 (>= 3.12~) [не ia64]

• dep: python3-click

  Command-Line Interface Creation Kit - Python 3.x

• dep: python3-coloredlogs

  colored terminal output for Python 3's logging module

• dep: python3-numpy (>= 1:1.25.0)

  Fast array facility to the Python language (Python 3)

• dep: python3-numpy-abi9

  виртуальный пакет, предоставляемый python3-numpy

Загрузка python3-cyvcf2

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Версия	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
alpha (неофициальный перенос)	0.31.1-2+b1	948,1 Кб	6 526,0 Кб	[список файлов]
amd64	0.31.1-2+b1	1 003,2 Кб	6 414,0 Кб	[список файлов]
arm64	0.31.1-2+b1	932,5 Кб	6 198,0 Кб	[список файлов]
armel	0.31.1-2+b1	945,0 Кб	6 216,0 Кб	[список файлов]
armhf	0.31.1-2+b1	951,4 Кб	5 804,0 Кб	[список файлов]
hppa (неофициальный перенос)	0.31.1-2+b1	967,9 Кб	7 114,0 Кб	[список файлов]
i386	0.31.1-2+b1	993,0 Кб	6 506,0 Кб	[список файлов]
ia64 (неофициальный перенос)	0.30.28-1+b1	1 027,9 Кб	6 797,0 Кб	[список файлов]
m68k (неофициальный перенос)	0.31.1-2+b1	589,3 Кб	5 108,0 Кб	[список файлов]
mips64el	0.31.1-2+b1	893,3 Кб	6 360,0 Кб	[список файлов]
ppc64 (неофициальный перенос)	0.31.1-2+b1	953,1 Кб	6 710,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	0.31.1-2+b1	962,0 Кб	6 582,0 Кб	[список файлов]
riscv64	0.31.1-2+b1	986,7 Кб	5 968,0 Кб	[список файлов]
s390x	0.31.1-2+b1	964,9 Кб	6 356,0 Кб	[список файлов]
sh4 (неофициальный перенос)	0.31.1-2+b1	765,3 Кб	5 192,0 Кб	[список файлов]
sparc64 (неофициальный перенос)	0.31.1-2+b1	907,4 Кб	6 852,0 Кб	[список файлов]
x32 (неофициальный перенос)	0.31.1-2	889,1 Кб	5 543,0 Кб	[список файлов]