Пакет: python3-cyvcf2 (0.31.1-2 и другие)

[ Источник: cyvcf2  ]

VCF parser based on htslib (Python 3)

This modules allows fast parsing of VCF and BCF including region-queries with Python. This is essential for efficient analyses of nucleotide variation with Python on high-throughput sequencing data.

cyvcf2 is a cython wrapper around htslib. Attributes like variant.gt_ref_depths return a numpy array directly so they are immediately ready for downstream use.

This package installs the library for Python 3.

Другие пакеты, относящиеся к python3-cyvcf2

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.7) [не alpha, amd64, arm64, ia64, ppc64el, riscv64, sh4, x32]

• dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.7) [alpha]

• dep: libhts3t64 (>= 1.17)

  C library for high-throughput sequencing data formats

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

  dep: python3 (<< 3.13) [ia64, x32]

  dep: python3 (<< 3.14) [не ia64, x32]

  dep: python3 (>= 3.11~) [ia64]

  dep: python3 (>= 3.12~) [не ia64]

• dep: python3-click

  Command-Line Interface Creation Kit - Python 3.x

• dep: python3-coloredlogs

  colored terminal output for Python 3's logging module

• dep: python3-numpy [не alpha, ia64, x32]

  Python library for numerical computations (Python 3)

  dep: python3-numpy (>= 1:1.25.0) [alpha, ia64, x32]

• dep: python3-numpy-abi9 [alpha, ia64, x32]

  виртуальный пакет, предоставляемый python3-numpy

• dep: python3-numpy2-abi0 [не alpha, ia64, x32]

  виртуальный пакет, предоставляемый python3-numpy

  или python3-numpy-abi9

  виртуальный пакет, предоставляемый python3-numpy

Загрузка python3-cyvcf2

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Версия	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
alpha (неофициальный перенос)	0.31.1-2+b1	948,1 Кб	6 526,0 Кб	[список файлов]
amd64	0.31.1-2+b2	1 002,9 Кб	6 434,0 Кб	[список файлов]
arm64	0.31.1-2+b2	933,2 Кб	6 222,0 Кб	[список файлов]
armel	0.31.1-2+b2	946,9 Кб	6 328,0 Кб	[список файлов]
armhf	0.31.1-2+b2	952,0 Кб	5 944,0 Кб	[список файлов]
hppa (неофициальный перенос)	0.31.1-2+b2	969,8 Кб	7 133,0 Кб	[список файлов]
i386	0.31.1-2+b3	997,0 Кб	6 525,0 Кб	[список файлов]
ia64 (неофициальный перенос)	0.30.28-1+b1	1 027,9 Кб	6 797,0 Кб	[список файлов]
m68k (неофициальный перенос)	0.31.1-2+b2	590,6 Кб	5 131,0 Кб	[список файлов]
mips64el	0.31.1-2+b2	893,8 Кб	6 384,0 Кб	[список файлов]
ppc64 (неофициальный перенос)	0.31.1-2+b2	954,1 Кб	6 734,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	0.31.1-2+b2	961,8 Кб	6 606,0 Кб	[список файлов]
riscv64	0.31.1-2+b2	987,6 Кб	5 988,0 Кб	[список файлов]
s390x	0.31.1-2+b2	965,2 Кб	6 379,0 Кб	[список файлов]
sh4 (неофициальный перенос)	0.31.1-2+b2	767,7 Кб	5 215,0 Кб	[список файлов]
sparc64 (неофициальный перенос)	0.31.1-2+b2	909,1 Кб	6 876,0 Кб	[список файлов]
x32 (неофициальный перенос)	0.31.1-2	889,1 Кб	5 543,0 Кб	[список файлов]