Пакет: python3-cyvcf2 (0.31.1-2 и другие)

[ Источник: cyvcf2  ]

VCF parser based on htslib (Python 3)

This modules allows fast parsing of VCF and BCF including region-queries with Python. This is essential for efficient analyses of nucleotide variation with Python on high-throughput sequencing data.

cyvcf2 is a cython wrapper around htslib. Attributes like variant.gt_ref_depths return a numpy array directly so they are immediately ready for downstream use.

This package installs the library for Python 3.

Другие пакеты, относящиеся к python3-cyvcf2

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.39) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.7) [не alpha, amd64, arm64, ia64, ppc64el, riscv64, sh4, x32]

• dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.7) [alpha]

• dep: libhts3t64 (>= 1.17)

  C library for high-throughput sequencing data formats

• dep: python3

  интерактивный высокоуровневый объектно-ориентированный язык (версия python3 по умолчанию)

  dep: python3 (<< 3.13)

  dep: python3 (>= 3.11~) [ia64]

  dep: python3 (>= 3.12~) [не ia64]

• dep: python3-click

  Command-Line Interface Creation Kit - Python 3.x

• dep: python3-coloredlogs

  colored terminal output for Python 3's logging module

• dep: python3-numpy (>= 1:1.25.0)

  Fast array facility to the Python language (Python 3)

• dep: python3-numpy-abi9

  виртуальный пакет, предоставляемый python3-numpy

Загрузка python3-cyvcf2

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Версия	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
alpha (неофициальный перенос)	0.31.1-2	846,6 Кб	5 669,0 Кб	[список файлов]
amd64	0.31.1-2	877,9 Кб	5 581,0 Кб	[список файлов]
arm64	0.31.1-2	840,7 Кб	5 472,0 Кб	[список файлов]
armel	0.31.1-2	843,4 Кб	5 482,0 Кб	[список файлов]
armhf	0.31.1-2	846,9 Кб	5 278,0 Кб	[список файлов]
hppa (неофициальный перенос)	0.31.1-2	869,4 Кб	5 939,0 Кб	[список файлов]
i386	0.31.1-2	880,5 Кб	5 627,0 Кб	[список файлов]
ia64 (неофициальный перенос)	0.30.28-1+b1	1 027,9 Кб	6 797,0 Кб	[список файлов]
m68k (неофициальный перенос)	0.31.1-2	492,2 Кб	4 434,0 Кб	[список файлов]
mips64el	0.31.1-2	819,9 Кб	5 554,0 Кб	[список файлов]
ppc64 (неофициальный перенос)	0.31.1-2	864,3 Кб	5 728,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	0.31.1-2	869,0 Кб	5 664,0 Кб	[список файлов]
riscv64	0.31.1-2	874,1 Кб	5 360,0 Кб	[список файлов]
s390x	0.31.1-2	858,2 Кб	5 556,0 Кб	[список файлов]
sh4 (неофициальный перенос)	0.31.1-2	606,4 Кб	4 411,0 Кб	[список файлов]
sparc64 (неофициальный перенос)	0.31.1-2	831,7 Кб	5 800,0 Кб	[список файлов]
x32 (неофициальный перенос)	0.31.1-2	889,1 Кб	5 543,0 Кб	[список файлов]