Пакет: python3-cyvcf2 (0.31.1-2 и другие)

[ Источник: cyvcf2  ]

VCF parser based on htslib (Python 3)

This modules allows fast parsing of VCF and BCF including region-queries with Python. This is essential for efficient analyses of nucleotide variation with Python on high-throughput sequencing data.

cyvcf2 is a cython wrapper around htslib. Attributes like variant.gt_ref_depths return a numpy array directly so they are immediately ready for downstream use.

This package installs the library for Python 3.

Другие пакеты, относящиеся к python3-cyvcf2

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.40) [loong64, sh4]

  dep: libc6 (>= 2.7) [armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, ppc64, s390x, sparc64]

• dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.7) [alpha]

• dep: libhts3t64 (>= 1.17)

  C library for high-throughput sequencing data formats

• dep: python3

  интерактивный высокоуровневый объектно-ориентированный язык (версия python3 по умолчанию)

  dep: python3 (<< 3.13) [ia64]

  dep: python3 (<< 3.14) [не ia64]

  dep: python3 (>= 3.11~) [ia64]

  dep: python3 (>= 3.13~) [не ia64]

• dep: python3-click

  Command-Line Interface Creation Kit - Python 3.x

• dep: python3-coloredlogs

  colored terminal output for Python 3's logging module

• dep: python3-numpy [не ia64]

  Python library for numerical computations (Python 3)

  dep: python3-numpy (>= 1:1.25.0) [ia64]

• dep: python3-numpy-abi9 [ia64]

  виртуальный пакет, предоставляемый python3-numpy

• dep: python3-numpy2-abi0 [не ia64]

  виртуальный пакет, предоставляемый python3-numpy

  или python3-numpy-abi9

  виртуальный пакет, предоставляемый python3-numpy

Загрузка python3-cyvcf2

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Версия	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
alpha (неофициальный перенос)	0.31.1-2+b3	850,2 Кб	5 691,0 Кб	[список файлов]
amd64	0.31.1-2+b3	886,6 Кб	5 624,0 Кб	[список файлов]
arm64	0.31.1-2+b3	849,1 Кб	5 559,0 Кб	[список файлов]
armel	0.31.1-2+b3	848,3 Кб	5 549,0 Кб	[список файлов]
armhf	0.31.1-2+b3	852,8 Кб	5 357,0 Кб	[список файлов]
hppa (неофициальный перенос)	0.31.1-2+b3	871,2 Кб	5 942,0 Кб	[список файлов]
i386	0.31.1-2+b4	881,9 Кб	5 645,0 Кб	[список файлов]
ia64 (неофициальный перенос)	0.30.28-1+b1	1 027,9 Кб	6 797,0 Кб	[список файлов]
loong64 (неофициальный перенос)	0.31.1-2+b3	870,9 Кб	5 623,0 Кб	[список файлов]
m68k (неофициальный перенос)	0.31.1-2+b3	494,1 Кб	4 464,0 Кб	[список файлов]
mips64el	0.31.1-2+b3	825,7 Кб	5 642,0 Кб	[список файлов]
ppc64 (неофициальный перенос)	0.31.1-2+b3	868,6 Кб	5 751,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	0.31.1-2+b3	874,6 Кб	5 751,0 Кб	[список файлов]
riscv64	0.31.1-2+b3	883,3 Кб	5 403,0 Кб	[список файлов]
s390x	0.31.1-2+b3	864,6 Кб	5 594,0 Кб	[список файлов]
sh4 (неофициальный перенос)	0.31.1-2+b3	615,1 Кб	4 497,0 Кб	[список файлов]
sparc64 (неофициальный перенос)	0.31.1-2+b3	835,4 Кб	5 823,0 Кб	[список файлов]
x32 (неофициальный перенос)	0.31.1-2+b3	892,5 Кб	5 570,0 Кб	[список файлов]