Paket: python3-cyvcf2 (0.31.1-2)

[ Quellcode: cyvcf2  ]

VCF parser based on htslib (Python 3)

This modules allows fast parsing of VCF and BCF including region-queries with Python. This is essential for efficient analyses of nucleotide variation with Python on high-throughput sequencing data.

cyvcf2 is a cython wrapper around htslib. Attributes like variant.gt_ref_depths return a numpy array directly so they are immediately ready for downstream use.

This package installs the library for Python 3.

Andere Pakete mit Bezug zu python3-cyvcf2

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.7) [nicht amd64, arm64, ppc64el, riscv64]

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  C-Bibliothek für Hochdurchsatz-Sequenzierungsdatenformate

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

  dep: python3 (<< 3.13)

  dep: python3 (>= 3.12~)

• dep: python3-click

  Command-Line Interface Creation Kit - Python 3.x

• dep: python3-coloredlogs

  colored terminal output for Python 3's logging module

• dep: python3-numpy (>= 1:1.25.0)

  Fast array facility to the Python language (Python 3)

• dep: python3-numpy-abi9

  virtuelles Paket, bereitgestellt durch python3-numpy

python3-cyvcf2 herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
amd64	877,9 kB	5.581,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	840,7 kB	5.472,0 kB	[Liste der Dateien]
armel	843,4 kB	5.482,0 kB	[Liste der Dateien]
armhf	846,9 kB	5.278,0 kB	[Liste der Dateien]
i386	880,5 kB	5.627,0 kB	[Liste der Dateien]
mips64el	819,9 kB	5.554,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	869,0 kB	5.664,0 kB	[Liste der Dateien]
riscv64	874,1 kB	5.360,0 kB	[Liste der Dateien]
s390x	858,2 kB	5.556,0 kB	[Liste der Dateien]