Paket: python3-cyvcf2 (0.31.1-2 und andere)

[ Quellcode: cyvcf2  ]

VCF parser based on htslib (Python 3)

This modules allows fast parsing of VCF and BCF including region-queries with Python. This is essential for efficient analyses of nucleotide variation with Python on high-throughput sequencing data.

cyvcf2 is a cython wrapper around htslib. Attributes like variant.gt_ref_depths return a numpy array directly so they are immediately ready for downstream use.

This package installs the library for Python 3.

Andere Pakete mit Bezug zu python3-cyvcf2

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.7) [nicht amd64, arm64, ppc64el, riscv64]

• dep: libhts3t64 (>= 1.17)

  C-Bibliothek für Hochdurchsatz-Sequenzierungsdatenformate

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

  dep: python3 (<< 3.14)

  dep: python3 (>= 3.13~)

• dep: python3-click

  Command-Line Interface Creation Kit - Python 3.x

• dep: python3-coloredlogs

  colored terminal output for Python 3's logging module

• dep: python3-numpy

  Python library for numerical computations (Python 3)

• dep: python3-numpy2-abi0

  virtuelles Paket, bereitgestellt durch python3-numpy

  oder python3-numpy-abi9

  Paket nicht verfügbar

python3-cyvcf2 herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Version	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
amd64	0.31.1-2+b3	886,6 kB	5.624,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	0.31.1-2+b3	849,1 kB	5.559,0 kB	[Liste der Dateien]
armel	0.31.1-2+b3	848,3 kB	5.549,0 kB	[Liste der Dateien]
armhf	0.31.1-2+b3	852,8 kB	5.357,0 kB	[Liste der Dateien]
i386	0.31.1-2+b4	881,9 kB	5.645,0 kB	[Liste der Dateien]
mips64el	0.31.1-2+b3	825,7 kB	5.642,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	0.31.1-2+b3	874,6 kB	5.751,0 kB	[Liste der Dateien]
riscv64	0.31.1-2+b3	883,3 kB	5.403,0 kB	[Liste der Dateien]
s390x	0.31.1-2+b3	864,6 kB	5.594,0 kB	[Liste der Dateien]