Paket: python3-cyvcf2 (0.31.1-2 und andere)

[ Quellcode: cyvcf2  ]

VCF parser based on htslib (Python 3)

This modules allows fast parsing of VCF and BCF including region-queries with Python. This is essential for efficient analyses of nucleotide variation with Python on high-throughput sequencing data.

cyvcf2 is a cython wrapper around htslib. Attributes like variant.gt_ref_depths return a numpy array directly so they are immediately ready for downstream use.

This package installs the library for Python 3.

Andere Pakete mit Bezug zu python3-cyvcf2

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

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  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

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  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.7) [nicht alpha, amd64, arm64, ia64, ppc64el, riscv64, sh4, x32]

• dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.7) [alpha]

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  C-Bibliothek für Hochdurchsatz-Sequenzierungsdatenformate

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  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

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  dep: python3 (<< 3.14) [nicht ia64]

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  dep: python3 (>= 3.13~) [nicht ia64]

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  virtuelles Paket, bereitgestellt durch python3-numpy

  oder python3-numpy-abi9

  virtuelles Paket, bereitgestellt durch python3-numpy

python3-cyvcf2 herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Version	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
alpha (inoffizielle Portierung)	0.31.1-2+b3	850,2 kB	5.691,0 kB	[Liste der Dateien]
amd64	0.31.1-2+b3	886,6 kB	5.624,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	0.31.1-2+b3	849,1 kB	5.559,0 kB	[Liste der Dateien]
armel	0.31.1-2+b3	848,3 kB	5.549,0 kB	[Liste der Dateien]
armhf	0.31.1-2+b3	852,8 kB	5.357,0 kB	[Liste der Dateien]
hppa (inoffizielle Portierung)	0.31.1-2+b3	871,2 kB	5.942,0 kB	[Liste der Dateien]
i386	0.31.1-2+b4	881,9 kB	5.645,0 kB	[Liste der Dateien]
ia64 (inoffizielle Portierung)	0.30.28-1+b1	1.027,9 kB	6.797,0 kB	[Liste der Dateien]
m68k (inoffizielle Portierung)	0.31.1-2+b3	494,1 kB	4.464,0 kB	[Liste der Dateien]
mips64el	0.31.1-2+b3	825,7 kB	5.642,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64 (inoffizielle Portierung)	0.31.1-2+b3	868,6 kB	5.751,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	0.31.1-2+b3	874,6 kB	5.751,0 kB	[Liste der Dateien]
riscv64	0.31.1-2+b3	883,3 kB	5.403,0 kB	[Liste der Dateien]
s390x	0.31.1-2+b3	864,6 kB	5.594,0 kB	[Liste der Dateien]
sh4 (inoffizielle Portierung)	0.31.1-2+b3	615,1 kB	4.497,0 kB	[Liste der Dateien]
sparc64 (inoffizielle Portierung)	0.31.1-2+b3	835,4 kB	5.823,0 kB	[Liste der Dateien]
x32 (inoffizielle Portierung)	0.31.1-2+b3	892,5 kB	5.570,0 kB	[Liste der Dateien]